Labelfree非標(biāo)記定量
服務(wù)介紹：
蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)指的是大規(guī)模、高通量地研究一個(gè)細(xì)胞、組織或物種中表達(dá)的全套蛋白質(zhì)的學(xué)科。近十年來，質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展大大推動(dòng)了的蛋白質(zhì)組學(xué)的進(jìn)步，基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成為蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域的技術(shù)手段。通過蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可以對(duì)生物樣本中的蛋白質(zhì)、翻譯后修飾位點(diǎn)(如磷酸化)進(jìn)行大規(guī)模地鑒定或定量，進(jìn)而從高通量的數(shù)據(jù)分析中挖掘有價(jià)值的信息和規(guī)律，為功能機(jī)制的探究提供線索和基礎(chǔ)。2003年，人類基因組計(jì)劃(HGP)完成精細(xì)圖的繪制后，同年，人類蛋白質(zhì)組學(xué)計(jì)劃(HPP)隨即開展起來，反映了科研領(lǐng)域?qū)Φ鞍踪|(zhì)組學(xué)的重視。經(jīng)過十年時(shí)間，多家單位的共同努力下，人類蛋白質(zhì)組草圖也于2014年在Nature雜志公布了。
蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)(Label-Free)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度，從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。其原理是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度來分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，其認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測(cè)的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測(cè)計(jì)數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來，從而對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。
Label-Free定量技術(shù)常用于研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組各類樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異，發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)記物等。
實(shí)驗(yàn)流程：
蛋白提取—蛋白酶解—肽段富集—高分辨質(zhì)譜檢測(cè)采集數(shù)據(jù)—數(shù)據(jù)庫(kù)檢索—數(shù)據(jù)分析
送樣運(yùn)輸要求：
1、蛋白樣本
?、俚鞍琢看笥?00ug，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、诮ㄗh測(cè)定蛋白濃度后，液氮速凍，避免蛋白降解，另外需要告知蛋白溶液的緩沖液成分和濃度，方便實(shí)驗(yàn)室收到后進(jìn)行后續(xù)處理。
?、勰z條、膠點(diǎn)樣本不建議進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)。
2、細(xì)胞樣本
①細(xì)胞量1x107個(gè)，收集細(xì)胞沉淀，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
②收集時(shí)，用預(yù)冷PBS緩沖液清洗三次，去除培養(yǎng)基成分，然后離心去除上清保存。
3、血清樣本
?、贅颖玖?00uL，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、跇颖緫?yīng)盡量避免溶血。
4、血漿樣本
?、贅颖玖?00uL，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、跇颖緫?yīng)盡量避免溶血。
5、尿液樣本
?、贅颖玖?mL，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、跇悠窇?yīng)盡量避免帶入糞便殘?jiān)?/span>
6、動(dòng)物組織樣本
?、贅颖玖?00mg，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、谑占瘯r(shí)，用預(yù)冷PBS緩沖液沖洗表面血液，并用濾紙吸干多余水分，避免凍存時(shí)結(jié)冰。
③固定液浸泡過的樣本無法進(jìn)行檢測(cè)。
7、植物組織樣本
?、贅颖玖?00mg，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
?、谑占瘯r(shí)，用預(yù)冷PBS緩沖液沖洗表面泥沙，并用濾紙吸干多余水分，避免凍存時(shí)結(jié)冰。
?、酃潭ㄒ航葸^的樣本無法進(jìn)行檢測(cè)。
8、微生物樣本
?、贅颖玖扛芍?00mg，-80℃保存，純干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。
②收集時(shí)，用預(yù)冷PBS緩沖液清洗三次，去除培養(yǎng)基成分，然后離心去除上清保存。
Labelfree非標(biāo)記定量
