.佛山市藥物結(jié)構(gòu)確認及雜質(zhì)分析-中科院CMA
佛山市藥物結(jié)構(gòu)確認及雜質(zhì)分析-中科院CMA
MRM 技術(shù)在蛋白質(zhì)與RNA 相互作用研究中的應用蛋白質(zhì)- R N A 復合物在調(diào)控真核細胞的基因表達上具有重要意義。基于M S 的方法研究蛋白質(zhì)與R N A 的相互作用多有報道，而采用M R M 與其他技術(shù)相結(jié)合的方法，能更深入地研究蛋白質(zhì)與RNA 作用的結(jié)構(gòu)域，得到更豐富的相互作用結(jié)構(gòu)信息。其原理是：通過母離子掃描的模式，獲得含有磷酸碎片的所有多肽離子的準確分子量和電荷數(shù)。設(shè)計MRM 離子對，母離子掃描獲得的信號離子作為母離子，子離子設(shè)定為堿基序列AUGC ，在MRM 的檢測域值達到設(shè)定值后，進行高分辨增強子離子掃描, 終獲取蛋白質(zhì)序列信息和與其作用的R N A 序列信息。Lenz 等[17]采用此方法，研究了U1SnRNP 和1515K-61K-U4atacSnRN 與RNA 的相互作用信息，分別用*和R N A 酶T 1、A 對蛋白質(zhì)和R N A 進行酶切，得到相互作用的短肽段和RNA 的短序列，在負離子模式進行母離子掃描，依據(jù)獲得的結(jié)果設(shè)計MRM 母- 子離子對，在正離子模式進行MRM-子離子增強掃描，后得到了相互作用結(jié)構(gòu)域等更為詳細的信息。
2、碳（13C）譜、DEPT譜
掃描譜寬249.0716Hz (250 ppm)，打印譜寬20551.725Hz (215ppm)。
DEPT譜輔助碳譜解析如下：δ 22.20為3位、4位的CH2 碳峰，δ 50.28為5位（或7位）的CH2 碳峰，δ 50.51為7位（或5位）的CH2 碳峰，δ 23.57為1'位的CH3碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶劑峰中，δ74.13為2'位的CH碳峰，δ 192.27為3'位的羰碳峰。數(shù)據(jù)見附表2。
2、碳（13C）譜、DEPT譜
掃描譜寬249.0716Hz (250 ppm)，打印譜寬20551.725Hz (215ppm)。
DEPT譜輔助碳譜解析如下：δ 22.20為3位、4位的CH2 碳峰，δ 50.28為5位（或7位）的CH2 碳峰，δ 50.51為7位（或5位）的CH2 碳峰，δ 23.57為1'位的CH3碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶劑峰中，δ74.13為2'位的CH碳峰，δ 192.27為3'位的羰碳峰。數(shù)據(jù)見附表2。
2、碳（13C）譜、DEPT譜
掃描譜寬249.0716Hz (250 ppm)，打印譜寬20551.725Hz (215ppm)。
DEPT譜輔助碳譜解析如下：δ 22.20為3位、4位的CH2 碳峰，δ 50.28為5位（或7位）的CH2 碳峰，δ 50.51為7位（或5位）的CH2 碳峰，δ 23.57為1'位的CH3碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶劑峰中，δ74.13為2'位的CH碳峰，δ 192.27為3'位的羰碳峰。數(shù)據(jù)見附表2。
儀器名稱及型號：超導脈沖付里葉變換核磁共振譜儀
德國 Bruker DRX-400
溶劑：CDCl3
質(zhì)子 序號 | 化學位移d(ppm) | 多重性 | 質(zhì)子數(shù) | 偶合 常數(shù)J (Hz) | 備注 | |
樟腦樣品 批號 Yz1408019 | 樟腦標準品 批號 110747-201008 | |||||
a | 0.84 | 0.84 | s | 3 |
| 8位CH3 |
b | 0.91 | 0.92 | s | 3 |
| 10位CH3 |
c | 0.96 | 0.96 | s | 3 |
| 9位CH3 |
d | 1.35 | 1.35 | m | 1 | 8.8, 3.2 | 5位CH2之一 |
e | 1.39 | 1.39 | m | 1 | 9.2, 4.4 | 6位CH2之一 |
f | 1.68 | 1.68 | dt | 1 | 13.2, 3.6 | 6位CH2之一 |
g | 1.85 | 1.85 | d | 1 | 18 | 3位CH2之一 |
h | 1.95 | 1.95 | m | 1 | 4.0 | 5位CH2之一 |
i | 2.09 | 2.09 | dd | 1 | 4 | 4位CH |
j | 2.36 | 2.36 | dt | 1 | 18, 4 | 3位CH2之一 |
