DNA測(cè)序原理
DNA測(cè)序技術(shù)主要依據(jù) Sanger 的雙脫氧鏈終止法。以DNA單鏈為模板,在特定條件下,用特異的引物在測(cè)序級(jí)DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,不斷將 4 種脫氧核糖核苷酸 (dNTP) 加到引物的 3'- 羥基末端并使引物鏈得到延伸。這種鏈的延伸是通過(guò)引物的 3'- 羥基和脫氧核糖核苷酸底物的 5'- 磷酸基團(tuán)形成磷酸二酯鍵來(lái)完成的。如果這種反應(yīng)體系中加入雙脫氧核糖核苷酸 (ddNTP) ,這種 2'3'ddNTP 的 5'- 磷酸基團(tuán)是正常的 (4 種不同的熒光標(biāo)記 ) ,而 3' 位置缺少羥基,因此在 DNA 聚合酶作用下,仍然可以通過(guò) 5'- 磷酸基團(tuán)與引物鏈的 3'- 羥基反應(yīng)摻入到引物鏈中,但是由于 ddNTP 沒(méi)有 3'- 羥基,不能繼續(xù)與下一個(gè) 5'- 磷酸基團(tuán)形成磷酸二酯鍵而導(dǎo)致引物鏈延伸的終止。這樣,在測(cè)序反應(yīng)體系中, DNA 引物鏈不斷合成與偶然終止,產(chǎn)生一系列的長(zhǎng)短不等的核苷酸鏈,然后將這些反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行電泳,即可得測(cè)序圖譜。
樣品要求
樣品類(lèi)型 | 相應(yīng)要求 |
菌體 | 1. 說(shuō)明載體抗性類(lèi)型,我們提供 Amp, Kan, Tet 及 Chl 四種抗生素。 |
質(zhì)粒 | 1. 質(zhì)粒溶于適量體積雙蒸水中(不含 TE ),電泳檢測(cè)總量大于 2mg 。 2. 建議用相關(guān)試劑盒純化。 |
未純化 PCR 產(chǎn)物 | 1. 片段大于 150bp 。 |
純化 PCR 產(chǎn)物 | 1.PCR 產(chǎn)物溶于雙蒸水中(不含 TE )。 2. 濃度大于 20ng/ul ,體積大于 20ul ,長(zhǎng)片段需適當(dāng)增加量。 |
自備的引物 | 1. 濃度不低于 5pmole/ul( 或 5umol/L) ,體積大于 20ul 。 |