在 1 × TBE 中分別用 GelRed 和 EB 預制 1% 瓊脂糖凝膠中 1Kb Plus DNA Ladder 稀釋物的電泳圖。從左至右各泳道 DNA 總量分別為 : 200 ng , 100 ng , 50 ng and 25 ng 。凝膠用 300nm 透視器顯像,用 EB 濾光片和 Polaroid 667 黑白膠片拍照
美國BIOTIUM公司技術專家研發(fā),由南京森貝伽生物提供的GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack廠家是種集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過美國*安全認定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會造成任何環(huán)境污染。(下載美國Litron Laboratories, Inc. 完整安全檢測報告)
Table A. 訂貨信息
Cat# | Product Name | Unit Size | 品 牌 |
41001 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 3X in water | 4.0 L | Biotium |
41002 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO | 0.5 mL | Biotium |
41003 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water | 0.5 mL | Biotium |
41003-1 | GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack | 10 mL | Biotium |
41004 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain,10,000X in DMSO | 0.5 mL | Biotium |
41005 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain,10,000X in water | 0.5mL | Biotium |
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目前大多數商業(yè)化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩(wěn)定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如,雖然 EB (溴化乙啶)作為目前使用zui廣泛的核酸凝膠染色試劑,能夠在多數應用中提供可以接受的靈敏度,但它是一種高誘變性的化學物質。而且EB染色后具有較高的背景熒光信號(如圖1)。 SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為zui靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預制凝膠中會快速降解,穩(wěn)定性差導致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認為是市場上較為安全的核酸染料 ,但它的染色效果還遠不及 SYBR Green I 。
至于國內有公司宣稱的新產品Goldview,我們不想多加評論。因為從極為相似的對比試驗結果來看,該產品似乎就是AO(丫啶橙 ,一種劇毒產品,且熒光亮度不佳)。請看Goldview 與 AO 對比試驗結果(其中Goldview是從國內某公司采購,AO則來自SIGMA,報告來自開放生物)
Biotium公司的GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack廠家無論用于預制凝膠染色還是凝膠電泳后染色,都表現出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統而設計的 GelRed ,在使用了我們新開發(fā)的具有的試驗步驟后(該試驗步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統的 TBE 緩沖溶液),在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同, GelRed 在預制凝膠中使用時仍然有*的靈敏度,事實上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現出更高的靈敏度,尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏(圖1)。 GelGreen 可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當,但不存在后者的不穩(wěn)定性問題。實際上, GelRed 和 GelGreen ,特別是 GelRed 非常穩(wěn)定,可以*在室溫下保存。當這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時甚至可以使用微波爐加熱,便于采用常規(guī)方法制備預制凝膠。含有染料的預制凝膠可以成批制備,*保存。
同樣重要的是,GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack廠家相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 獨立的測試服務公司( Litron Laboratories, Inc. )進行的標準艾姆斯氏測試結果表明, 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠高于*用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下, GelGreen 沒有誘變性,而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學結構使其難以穿透細胞膜進入細胞,正是這一特性降低了染料的細胞毒性。如圖3。相反, SYBR Green I 廣泛地用于活細胞線粒體和核 DNA 染色,這正是由于它能快速的被細胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導致的突變有強烈的增強作用( Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001) ),因此它的高細胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時成為凝膠染色的主要有害物質。
特性:
gelred 高靈敏度
GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack廠家是目前市場中zui靈敏的凝膠核酸染料
gelred 穩(wěn)定性*
可以使用微波爐加熱,可以在室溫下保存
gelred 更安全
艾姆斯氏試驗結果表明,該染料的誘變性遠小于 溴化乙錠 ( EB )
gelred 廣泛的適應性
適用于預制凝膠和凝膠電泳后染色
gelred 染色過程簡單
與 EB 一樣,在預制膠和電泳過程中不必擔心染料降解;而電泳后染色過程也只需 30 分鐘且無需脫色或沖洗
gelred 對 DNA 和 RNA 的遷移影響極小
對核酸遷移的影響小于 SYBR Green I
gelred 與標準凝膠成像系統以及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置*兼容
使用 312nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統時, GelRed 可以*的替代 EB ;使用 254nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統或可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置時, GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料(見圖 4 中的光譜圖)
安全性測試 | ||||
SYBR Dyes | GelRed | GelGreen | ||
A) 5 min. incubation | 要想讓DNA染色劑安全,*的辦法就是設法不讓其穿透細胞膜進入活體細胞內,Biotium 做到了! | |||
B) 30 min incubation |
圖 3. 在37°C下,分別使用1X SYBR Green I, SYBR Safe, GelRed and GelGreen 對HeLa 細胞進行孵化,并分別在5分鐘(A)和30分鐘(B)后觀察。實驗顯示SYBR染料迅速進入細胞并將細胞內的核酸染成亮綠色(以上僅圖示 SYBR Green 1),而 GelRed 和 GelGreen 則因為不能穿透細胞膜而*沒有進入細胞內, 足以證明GelRed和GelGreen是安全的。
圖 4. GelGreen (綠色) GelRed (紅色)在 PBS 緩沖溶液中結合 dsDNA 后的激發(fā)和發(fā)射光譜。 |
圖 5. 室溫下, GelRed TM ( 500 nm )和 SYBR Gold ( 488 nm )稀釋在 1 × TBE 凝膠染色液中測得的吸光度隨時間變化圖。 GelRed 和 SYBR Gold 初始的吸光度值分別為 0.029 和 0.051 。 |
Table B.以下標簽可以*地配合以上產品使用:
Cat# | Product Name | Unit Size | 品 牌 |
31021 | 1 KB DNA Ladder (100ng/uL) | 30 ug/300 ul | Biotium |
31022 | Ready-to-Use 1 KB DNA Ladder | 150 applications (1.5 ml) | Biotium |
** 一次購買5個包裝以上可獲得更優(yōu)惠價格,立刻我們的。 |
鄭重聲明:
凡是市場上聲稱具有與Gelred和Gelgreen相同特性的 EB 替代品,且不指明是 Biotium 公司品牌的核酸染料,經檢驗都是通過Gelred或 Gelgreen稀釋后重新包裝的水貨,染色質量遠不及Biotium原包裝產品。我們鄙視這種損害客戶利益的行為,并堅決打擊,發(fā)現一次我們將不再向其供貨! 在此,我們呼吁用戶在購買Biotium公司產品時, 請選擇正規(guī)經銷商。