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來自北卡羅來納州大學教堂山分校(University of north carolina at chapel hill),哈佛醫(yī)學院的研究人員進行了針對植物的蛋白相互作用系統(tǒng)分析,獲得了*個植物系統(tǒng)蛋白相互作用圖譜(Plant Interactome),這對于分析了解植物蛋白相互關系具有重要的意義。這一研究成果公布在Science雜志上。
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文章的通訊作者包括Jeffery L. Dangl教授等多人,其中來自北卡羅來納大學的Dangl教授是的生物學家,曾在植物對疾病產生應答的信號過程,以及基因分析研究方面獲得重要成果。2007年當選為美國國家*院士。
這項研究是“擬南芥蛋白互作組圖譜聯(lián)盟”的一項成果——“擬南芥蛋白互作組圖譜聯(lián)盟”是由20多個國立和實驗室組成的,致力于了解植物蛋白相互關聯(lián)的項目,歷時4年,由美國國家科學基金會National Science Foundation 資助800萬美元。
研究人員首先分析獲得了上萬個開放閱讀框(ORF),然后利用酵母雙雜交技術對這些ORF進行檢測,結果在40萬次蛋白分析實驗中,共發(fā)現(xiàn)了6250個蛋白互作樣本,其中有2774種蛋白參與。這些蛋白互作樣本在擬南芥完整蛋白作用譜中僅占大約2%,這主要是由于分析實驗僅覆蓋擬南芥完整蛋白的三分之一,而且由于靈敏度的原因,許多較弱的蛋白相互作為無法檢測到。這也就是說未來也許還會有更全面的蛋白作用圖譜。
不過利用*植物蛋白互作圖譜,研究人員可以將整理分類這些互作蛋白,從而可以用于揭示協(xié)同作用蛋白的系統(tǒng)網絡。研究人員發(fā)現(xiàn)1900對互作蛋白可能是原始基因拷貝擴增的產物,而擬南芥基因組數(shù)據(jù)表明植物基因的隨機拷貝數(shù)比動物的多,這些基因拷貝使得植物具有適應環(huán)境變化的遺傳多樣性。
研究人員還利用*的測序技術,演算出了單一基因拷貝擴增事件的時間跨度,并比較了基因拷貝擴增和結合蛋白成分的變化,這將有助于科學家們估算進化過程中這些蛋白的功能如何在一起。
這些研究數(shù)據(jù)為科學家們提供了蛋白互作的雙重數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù),以及將來的蛋白互作組圖譜將組成一個信息庫,利用這些信息,研究人員將可以獲得具有更高的抗旱性、抗病性的農業(yè)物,以及更有營養(yǎng),對人類更有益的新型農產品。
來源:生物通
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