德國(guó)大腸桿菌檢測(cè)試劑盒在深圳研制成功

   華大基因研究院發(fā)布研究進(jìn)展，公布了第三版的含有測(cè)序數(shù)據(jù)的大腸桿菌基因組完成圖譜，并且華大基因與其合作研究小組已研制出該大腸桿菌的診斷試劑盒，將無(wú)償提供檢測(cè)實(shí)驗(yàn)方法細(xì)節(jié)及所需引物序列信息，給范圍內(nèi)的病情診斷、疫情監(jiān)測(cè)和污染源調(diào)查提供支持。

自5月中旬德國(guó)大腸桿菌疫情爆發(fā)以來(lái)，已對(duì)德國(guó)的公眾健康造成了嚴(yán)重的危害，疫情也正陸續(xù)蔓延至歐洲各地?？蒲泄ぷ髡邆冋蒙钲谌A大基因研究院早前公布的該大腸桿菌基因組序列信息積極的開(kāi)展研究，為早日結(jié)束這場(chǎng)疫情而共同努力。

華大基因的研究團(tuán)隊(duì)整合了之前發(fā)表的Ion Torrent數(shù)據(jù)和基于Illumina公司Hiseq測(cè)序平臺(tái)新產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，并進(jìn)行序列拼接，從而得到*個(gè)真正意義上基于從頭測(cè)序的組裝結(jié)果。這次新發(fā)表的全基因組組裝結(jié)果，比早前發(fā)布的版本更加完整（完整度>99%）并且修正了之前可能出現(xiàn)的組裝錯(cuò)誤。對(duì)該版本的基因組序列的分析也同樣證實(shí)了該大腸桿菌含有來(lái)自腸出血性大腸桿菌（EHEC）和腸黏附性大腸桿菌（EAEC）的致病基因。

基于之前的研究發(fā)現(xiàn)，華大基因與軍事醫(yī)學(xué)*微生物流行病研究所的科研人員迅速開(kāi)展了針對(duì)該大腸桿菌的診斷試劑盒的研發(fā)。并且于昨日驗(yàn)證完成了可快速檢測(cè)該大腸桿菌菌株的PCR診斷方案。該診斷方法主要通過(guò)兩對(duì)特異性引物的擴(kuò)增，而鑒定出與黏附性及出血性相關(guān)基因結(jié)合。該方法可在收到樣品后2～3小時(shí)內(nèi)提供診斷結(jié)果，其對(duì)疫情監(jiān)控和和致病病菌的檢測(cè)起著重要作用。

華大基因?qū)υ噭┖械撵`敏度和特異性進(jìn)行數(shù)據(jù)分析及實(shí)驗(yàn)測(cè)試，證明了該檢測(cè)方案具有高度特異性。靈敏度實(shí)驗(yàn)檢測(cè)結(jié)果也表明，該方法在DNA濃度低至約1皮克（10～12克）的反應(yīng)體系中仍可檢測(cè)出該菌株。更多的驗(yàn)證試驗(yàn)將會(huì)在本周繼續(xù)開(kāi)展。同時(shí)，為了更好地控制此疫情的傳播，華大基因與軍事醫(yī)學(xué)*微生物流行病研究所將免費(fèi)為疾病控制和研究機(jī)構(gòu)提供合成引物，為監(jiān)控及預(yù)防范圍內(nèi)疫情的擴(kuò)散提供幫助。