研究發(fā)現(xiàn)，越來越多的非編碼RNA（ncRNA）與各種人類疾病有關(guān)，包括癌癥，但是，肝細(xì)胞癌（HCC）的ncRNA轉(zhuǎn)錄組在很大程度上還是未知的。
zui近，研究人員帶領(lǐng)的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，逆轉(zhuǎn)錄病毒長末端重復(fù)序列（LTR）啟動(dòng)子——廣泛分布于人類基因組中的一種重復(fù)性元件，在肝細(xì)胞癌（肝癌zui常見的類型）中是高度活化的。有趣的是，這些區(qū)域——在與病毒性肝炎相關(guān)的HCCs中被特別激活，在肝臟中通常是不被激活的，但在生殖組織（如睪丸和胎盤）中是被激活的。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在zui近的《Genome Research》，表明LTR啟動(dòng)子的激活，可能會(huì)導(dǎo)致肝癌的發(fā)展。
逆轉(zhuǎn)錄病毒LTRs被廣泛認(rèn)為是逆轉(zhuǎn)錄病毒（如HIV病毒）的殘留物，它失去了退出細(xì)胞的能力，成為基因組中的寄生元件。研究人員指出：“由于這些病毒元件包含的元件能夠發(fā)揮轉(zhuǎn)錄本那樣的功能，因此，生物體有時(shí)會(huì)為了自己的目的而使用這些LTRs，實(shí)際上它們在生殖組織中是高度活化的，如我們早期在ES和iPS細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的那樣。"
該研究團(tuán)隊(duì)采用CAGE技術(shù)——RIKEN開發(fā)的一種技術(shù)，來研究RNA在肝癌腫瘤與非腫瘤組織（取自同一患者）中的表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn)，有4756個(gè)非編碼啟動(dòng)子，相比較非腫瘤組織，它們在腫瘤組織中有更高的活性，值得注意的是，其中935個(gè)啟動(dòng)子位于逆轉(zhuǎn)錄病毒的LTRs中。
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