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Arraystar lncRNA芯片應(yīng)用于動(dòng)脈粥樣硬化研究

閱讀:140發(fā)布時(shí)間:2016-6-3

 

動(dòng)脈粥樣硬化是一種脂質(zhì)代謝與炎癥性血管病變,是引起心腦血管時(shí)間的常見(jiàn)疾病。來(lái)自廣州南方醫(yī)院的研究者發(fā)現(xiàn)動(dòng)脈粥樣硬化新的分子機(jī)制,解釋了斑塊形成過(guò)程中非編碼RNA RP5-833A20.1如何通過(guò)microRNA和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控了炎癥因子以及細(xì)胞內(nèi)的脂肪運(yùn)輸過(guò)程,有可能對(duì)疾病治療產(chǎn)生重要影響。

研究背景

動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的形成與血管內(nèi)皮細(xì)胞,血管平滑肌細(xì)胞以及巨噬細(xì)胞有關(guān)。巨噬細(xì)胞吞噬大量氧化型低密度脂蛋白*,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)堆積,形成泡沫細(xì)胞從而促發(fā)了動(dòng)脈粥樣硬化的炎癥反應(yīng);構(gòu)成脂質(zhì)核心和動(dòng)脈粥樣硬化病變。lncRNA的研究得到了世界范圍的關(guān)注。此前雖然有發(fā)現(xiàn)心血管相關(guān)lncRNA的報(bào)道,然而數(shù)目有限,該領(lǐng)域還有廣闊的研究空間。

研究思路

該研究利用THP-1巨噬細(xì)胞和THP-1來(lái)源的泡沫細(xì)胞進(jìn)行比較,找到100個(gè)差異表達(dá)的lncRNA,63個(gè)mRNA分子(差異倍數(shù)大于3,p值小于0.01)。通路網(wǎng)絡(luò)分析表明差異表達(dá)的基因參與動(dòng)脈粥樣硬化,G蛋白耦聯(lián)受體等重要通路。從差異表達(dá)的分子中選擇與疾病相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子NFIA以及位于其內(nèi)含子中的lncRNA RP5-833A20.1進(jìn)行深入研究。

過(guò)表達(dá)和干擾實(shí)驗(yàn)證明lncRNA RP5-833A20.1對(duì)NFIA具有負(fù)調(diào)控作用。分子機(jī)制實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)mir-382-5p可結(jié)合NFIA3 UTR區(qū)域抑制NFIA 表達(dá),而RP5-833A20.1參與了mir-382-5p的成熟加工過(guò)程。體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)證明RP5-833A20.1/mir-382-5p/NFIA通路調(diào)控了炎癥細(xì)胞因子的表達(dá)以及細(xì)胞內(nèi)的脂肪聚集;小鼠活體實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)NFIA過(guò)表達(dá)顯著抑制斑塊的形成,降低循環(huán)系統(tǒng)中的炎癥因子濃度,促進(jìn)*代謝的作用,是可能的動(dòng)脈粥樣硬化治療靶點(diǎn)。

研究意義該研究從疾病細(xì)胞模型出發(fā),通過(guò)芯片篩選以及基因組注釋信息找到重要的lncRNA分子和它的靶標(biāo),以microRNA為媒介串聯(lián)成一條完整的通路。體外及體內(nèi)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)系統(tǒng)和完整,找到了關(guān)鍵的治療靶點(diǎn)。為的心血管疾病lncRNA研究開(kāi)拓了研究思路。


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