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與智力殘疾可能相關(guān)的10個(gè)基因

閱讀：298發(fā)布時(shí)間：2016-10-25

 

荷蘭一個(gè)研究小組對(duì)數(shù)千個(gè)de novo突變進(jìn)行薈萃分析，鑒定出10個(gè)智力殘疾的候選基因，這些突變是從兩千多個(gè)患病家庭的外顯子組序列中鑒定出的。

在這項(xiàng)研究中，研究人員對(duì)820名患有輕度至重度智力殘疾的兒童及其父母進(jìn)行外顯子組測(cè)序，隨后綜合了已發(fā)表研究中其他1,300個(gè)家庭的序列信息。當(dāng)他們分析這些家庭中的2,637個(gè)de novo突變時(shí)，他們發(fā)現(xiàn)10個(gè)基因與智力殘疾相關(guān)。

研究小組以820名患病兒童及其父母為研究對(duì)象，利用安捷倫的SureSelect技術(shù)富集了基因組的蛋白編碼區(qū)域，并利用Illumina的HiSeq儀器進(jìn)行測(cè)序。

在平均覆蓋深度達(dá)75倍的外顯子組中，研究人員發(fā)現(xiàn)了1,083個(gè)可疑的de novo突變，影響到915個(gè)基因。考慮到基因特異的突變率，他們發(fā)現(xiàn)18個(gè)已知的智力殘疾基因，似乎不成比例地受到de novo突變的影響。

為了梳理出新的候選基因，研究小組剔除了已知基因中含有突變的個(gè)體，并重復(fù)分析，將頻繁發(fā)生的de novo突變縮小到4個(gè)基因上：DLG4、PPM1D、SOX5和TCF20。此外，研究人員利用已發(fā)表研究中的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)了另外6個(gè)候選基因。

在薈萃分析中，研究人員對(duì)1,471名個(gè)體中的1,235個(gè)基因進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)除了上面的4個(gè)基因之外，還有6個(gè)基因：RAC1、SMAD6、SON、TLK2、TRIP12和SYNCRIP，它們也包含許多功能喪失的de novo突變。

研究小組指出，一些基因中的de novo突變似乎產(chǎn)生了重疊的臨床特征，包括兩名兒童中TLK2基因的突變帶來(lái)了相似的面部畸形。新分析中受到de novo突變影響的許多基因或通路與其他疾病的關(guān)聯(lián)基因重疊，包括自閉癥譜系障礙或其他神經(jīng)發(fā)育疾病。

研究強(qiáng)調(diào)了de novo突變對(duì)各種神經(jīng)發(fā)育表型的影響，并指出“大量的罕見(jiàn)發(fā)育障礙基因仍有待確定”。


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