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RNA產(chǎn)品特點:
1.針對血液樣本*配置,操作更簡單、流程更優(yōu)化。
2.配有高效的DNaseⅠ,可有效去除DNA污染。
3.配有CS過濾柱,可有效去除其它雜質(zhì)。
4.RNA純度更高,無雜質(zhì)殘留,特別適合于對純度要求很高的下游實驗。
5.操作安全可靠,無需酚/氯仿抽提,無需氯化銫梯度離心,無需氯化鋰或乙醇沉淀
用于血液樣本處理對RNA測序數(shù)據(jù)影響的研究
以血液這一為常用的臨床樣本為研究對象,重點研究了血液儲存時間以及外周血單核細胞(PBMC)樣本分離方法對其RNA測序數(shù)據(jù)質(zhì)量的研究,對測序數(shù)據(jù)質(zhì)量及準確度進行了探索分析,在差異表達基因分析的基礎上找到了一些規(guī)律性變化且與儲存時間相關的基因。
該研究能夠拓展高通量測序在臨床相關研究中的應用,促進其進一步發(fā)展。論文的主要研究內(nèi)容如下:
1. 在PBMC樣本研究中,通過比較不同樣品處理間的基因表達差異,發(fā)現(xiàn)隨著貯藏時間的延長,差異逐漸擴大,而對總基因的影響不顯著。在PBMC測序數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了5個隨時間呈梯度差異的基因,它們都是免疫相關基因,這些基因在以前的研究中沒有提及,這提示我們按照常規(guī)的生物標記分子篩選方法而不注重樣本處理無疑會產(chǎn)生偏差。此外,離心速度的影響大于保存時間,不同的離心速度可誘導差異表達。本文還分析了不同的貯存時間和離心速度對相同樣品的影響,為血液保存時期如何操作和處理樣本提供了理論依據(jù)。
2.在全血樣本研究中,通過比較相同樣品不同儲存時間的基因表達差異,發(fā)現(xiàn)24小時之內(nèi)的基因表達差異不明顯。甚至于,人群差異大于儲存時間影響。然而,全血與PBMC的測序結(jié)果表明,大部分差異基因與紅細胞功能相關,這很有可能是血紅蛋白的權(quán)重太大造成的背景干擾。
因此,全血試劑盒提取RNA替代傳統(tǒng)PBMC提取雖然操作簡便,但血紅蛋白基因相關的背景干擾影響了結(jié)果。
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