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祝賀上海交通大學(xué)陶生策研究組發(fā)現(xiàn)新蛋白質(zhì)去乙?;?,上海交大的老師和學(xué)生曾多次訂購(gòu)我司elisa試劑盒,生化試劑等產(chǎn)品,對(duì)于老師們?nèi)〉玫某煽?jī),我們表示衷心的祝賀!
2015年12月30日,期刊《eLife》雜志在線發(fā)表上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院陶生策研究員與美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)朱衡教授和Philip A. Cole教授聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)的一篇研究論文,研究人員利用蛋白質(zhì)組芯片,以大腸桿菌為模型,發(fā)現(xiàn)了一種全新的蛋白質(zhì)去乙酰化酶YcgC。研究得到自然科學(xué)基金以及科技部863計(jì)劃的資助,上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院的涂順和郭書娟、中國(guó)臺(tái)灣中央大學(xué)的Chien-sheng chen(陳健生)副教授為文章共同*作者,上海交通大學(xué)陶生策研究員及約翰霍普金斯大學(xué)的朱衡教授和Philip A. Cole教授為文章共同通訊作者。
陶生策教授主要研究方向?yàn)榈鞍踪|(zhì)芯片的構(gòu)建和應(yīng)用,構(gòu)建了世界上*張基于純化蛋白質(zhì)的肺結(jié)核桿分枝桿菌蛋白質(zhì)芯片,并以蛋白質(zhì)芯片為平臺(tái)在蛋白翻譯后修飾方面進(jìn)行了系列有影響的工作。
蛋白質(zhì)是由基因所編碼,蛋白質(zhì)在其生命周期內(nèi)往往會(huì)被打上不同類型的修飾,而且這些修飾往往也是動(dòng)態(tài)變化的。蛋白質(zhì)翻譯后修飾會(huì)以極其精細(xì)的方式影響和調(diào)控蛋白質(zhì)的功能。乙酰化作為一種重要且廣泛存在的蛋白質(zhì)翻譯后修飾類型,與一系列重要疾病密切相關(guān),影響眾多關(guān)鍵的生物學(xué)過(guò)程。隨著蛋白質(zhì)組技術(shù)的進(jìn)步,目前已經(jīng)從低等的大腸桿菌到高等的人等眾多生物的細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了成千上萬(wàn)的乙酰化修飾。蛋白質(zhì)的乙?;梢阴^D(zhuǎn)移酶和去乙?;杆{(diào)控。對(duì)應(yīng)海量的蛋白質(zhì)乙?;揎?,目前已知的乙?;负腿ヒ阴;笖?shù)目非常有限,仍有相當(dāng)數(shù)目的新酶有待發(fā)現(xiàn),一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題是“如何實(shí)現(xiàn)乙?;嚓P(guān)酶的發(fā)現(xiàn)?”。針對(duì)這一問(wèn)題,本文作者發(fā)展了一套稱之為“Clip-chip”的技術(shù),在大腸桿菌蛋白質(zhì)組芯片的基礎(chǔ)上,進(jìn)行了全局性蛋白質(zhì)去乙?;傅陌l(fā)現(xiàn),發(fā)現(xiàn)了一種新的去乙酰化酶YcgC。該酶能夠非常地去除底物蛋白R(shí)utR賴氨酸52位和賴氨酸62位的乙酰化。已知的蛋白質(zhì)去乙?;傅幕钚砸蕾囉贜AD+或者Zn2+,但YcgC的去乙酰化活性并不依賴于以上兩者。進(jìn)一步的功能實(shí)驗(yàn)表明,YcgC通過(guò)去乙?;绊慠utR的轉(zhuǎn)錄調(diào)控活性。在實(shí)驗(yàn)中作者還發(fā)現(xiàn)RutR具有蛋白酶活性,YcgC通過(guò)去乙酰化能夠調(diào)節(jié)RutR的蛋白酶活性。作者比較了YcgC與大腸桿菌中*的去乙?;窩obB對(duì)大腸桿菌表達(dá)譜的影響,結(jié)果表明,兩者既有相似點(diǎn),也有的不同,提示YcgC的底物譜與CobB的可能有的不同。通過(guò)全基因合成,作者獲得了來(lái)源于多個(gè)其它細(xì)菌的大腸桿菌YcgC的同源基因克隆,表達(dá)測(cè)試表明這些克隆所表達(dá)的蛋白均具有蛋白質(zhì)去乙酰化酶活性。
研究所發(fā)現(xiàn)的YcgC可能代表一個(gè)全新的蛋白質(zhì)去乙?;讣易?。同時(shí)本研究中所發(fā)展的Clip-chip技術(shù)具有通用性,可方便地移植于其它酶的發(fā)現(xiàn)中。
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