祝賀上海交通大學陶生策研究組發(fā)現新蛋白質去乙?;?,上海交大的老師和學生曾多次訂購我司elisa試劑盒,生化試劑等產品,對于老師們取得的成績,我們表示衷心的祝賀!
2015年12月30日,期刊《eLife》雜志在線發(fā)表上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院陶生策研究員與美國約翰霍普金斯大學朱衡教授和Philip A. Cole教授聯合研究團隊的一篇研究論文,研究人員利用蛋白質組芯片,以大腸桿菌為模型,發(fā)現了一種全新的蛋白質去乙酰化酶YcgC。研究得到自然科學基金以及科技部863計劃的資助,上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院的涂順和郭書娟、中國臺灣中央大學的Chien-sheng chen(陳健生)副教授為文章共同*作者,上海交通大學陶生策研究員及約翰霍普金斯大學的朱衡教授和Philip A. Cole教授為文章共同通訊作者。
陶生策教授主要研究方向為蛋白質芯片的構建和應用,構建了世界上*張基于純化蛋白質的肺結核桿分枝桿菌蛋白質芯片,并以蛋白質芯片為平臺在蛋白翻譯后修飾方面進行了系列有影響的工作。
蛋白質是由基因所編碼,蛋白質在其生命周期內往往會被打上不同類型的修飾,而且這些修飾往往也是動態(tài)變化的。蛋白質翻譯后修飾會以極其精細的方式影響和調控蛋白質的功能。乙?;鳛橐环N重要且廣泛存在的蛋白質翻譯后修飾類型,與一系列重要疾病密切相關,影響眾多關鍵的生物學過程。隨著蛋白質組技術的進步,目前已經從低等的大腸桿菌到高等的人等眾多生物的細胞中發(fā)現了成千上萬的乙?;揎?。蛋白質的乙酰化由乙酰轉移酶和去乙?;杆{控。對應海量的蛋白質乙?;揎?,目前已知的乙?;负腿ヒ阴;笖的糠浅S邢?,仍有相當數目的新酶有待發(fā)現,一個關鍵問題是“如何實現乙?;嚓P酶的發(fā)現?”。針對這一問題,本文作者發(fā)展了一套稱之為“Clip-chip”的技術,在大腸桿菌蛋白質組芯片的基礎上,進行了全局性蛋白質去乙?;傅陌l(fā)現,發(fā)現了一種新的去乙?;竃cgC。該酶能夠非常地去除底物蛋白RutR賴氨酸52位和賴氨酸62位的乙酰化。已知的蛋白質去乙酰化酶的活性依賴于NAD+或者Zn2+,但YcgC的去乙酰化活性并不依賴于以上兩者。進一步的功能實驗表明,YcgC通過去乙?;绊慠utR的轉錄調控活性。在實驗中作者還發(fā)現RutR具有蛋白酶活性,YcgC通過去乙酰化能夠調節(jié)RutR的蛋白酶活性。作者比較了YcgC與大腸桿菌中*的去乙?;窩obB對大腸桿菌表達譜的影響,結果表明,兩者既有相似點,也有的不同,提示YcgC的底物譜與CobB的可能有的不同。通過全基因合成,作者獲得了來源于多個其它細菌的大腸桿菌YcgC的同源基因克隆,表達測試表明這些克隆所表達的蛋白均具有蛋白質去乙?;富钚?。
研究所發(fā)現的YcgC可能代表一個全新的蛋白質去乙酰化酶家族。同時本研究中所發(fā)展的Clip-chip技術具有通用性,可方便地移植于其它酶的發(fā)現中。
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