剛果紅（Congo Red,簡稱CR）是一種燃料，他可與像纖維素這樣的多糖物質(zhì)形成紅色復合物，但并不和纖維素水解后的產(chǎn)物如纖維二糖或葡萄糖發(fā)生這種顯色反應，當我們在含有纖維素的培養(yǎng)基中加入剛果紅時，剛果紅能與培養(yǎng)基中的纖維素形成紅色復合物。當纖維素被纖維素分解菌分泌的纖維素酶分解后，剛果紅-纖維素的復合物就將無法形成，從而在培養(yǎng)基中形成以纖維素分解菌為中心的透明圈，這樣我們就可以通過是否產(chǎn)生透明圈來篩選纖維素分解菌。      
   常用的剛果紅染色法有兩種

方法一:
先培養(yǎng)微生物，再加入剛果紅進行顏色反應
在長出菌落的培養(yǎng)基上，覆蓋質(zhì)量濃度為1 mg/mI。的CR溶液，10～15 min后，倒去CR溶液，加入物質(zhì)的量濃度為l mol/l的NaCI溶液，15 min后倒掉NaCl溶液，此時，產(chǎn)生纖維素酶的菌落周圍將會出現(xiàn)透明圈。
（加NaCl的原因：剛果紅是結合到培養(yǎng)基的多糖底物，但分解纖維素的細菌可以產(chǎn)纖維素酶，能分解這個多糖底物成為寡糖，這樣剛果紅就不能結合上去了，氯化鈉就可以使結合不牢的剛果紅洗去，這樣就留下大小不一的透明圈，大的透明圈分解纖維素的能力就強）

方法二:
在倒平板時就加入剛果紅
配制質(zhì)量濃度為10 mg/mI的CR溶液，滅菌后，按照每200 mI。培養(yǎng)基加入1 mI。的比例加入CR溶液，混勻后倒平板。等培養(yǎng)基上長出茵落后，產(chǎn)生纖維素酶的菌落周圍將會出現(xiàn)明顯的透明圈