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利用CRISPR/Cas9在體內(nèi)成功切除HIV DNA片段

時(shí)間:2016-5-23閱讀:700
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作為一種RNA病毒,HIV是一種逆轉(zhuǎn)錄病毒。當(dāng)感染人細(xì)胞(主要是CD4+ T細(xì)胞)時(shí),它會將自身的RNA逆轉(zhuǎn)錄為DNA后插入到宿主基因組中以便進(jìn)行復(fù)制和合成新的病毒顆粒。

在一項(xiàng)新的研究中,來自美國天普大學(xué)劉易斯-卡茨醫(yī)學(xué)院的研究人員利用基因編輯技術(shù)成功地從活的動物基因組中切除HIV-1 DNA中的一段序列。這一突破是開發(fā)一種潛在地抵抗HIV感染的治療策略的關(guān)鍵一步。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2016年5月19日那期Gene Therapy期刊上,論文標(biāo)題為“Excision of HIV-1 DNA by gene editing: a proof-of-concept in vivo study”。 論文通信作者、天普大學(xué)劉易斯-卡茨醫(yī)學(xué)院神經(jīng)病毒學(xué)中心主任Kamel Khalili博士解釋道,“在這項(xiàng)概念驗(yàn)證的研究中,我們證實(shí)我們的基因編輯技術(shù)能夠地應(yīng)用于兩種小型模式動物的很多器官中,而且能夠?qū)IV病毒DNA的較大片段從宿主細(xì)胞基因組中切除。”

當(dāng)前的治療HIV感染的方法集中于抗逆轉(zhuǎn)錄病物的組合使用。盡管抗逆轉(zhuǎn)錄病物療法能夠有效地抑制HIV復(fù)制,但是這不能夠?qū)IV-1從被HIV感染的細(xì)胞中清除。再者,當(dāng)抗逆轉(zhuǎn)錄病毒療法停止時(shí),HIV復(fù)制卷土重來,從而使得病人面臨著患上獲得性免疫綜合征(AIDS,一種由HIV感染導(dǎo)致的疾病)的風(fēng)險(xiǎn)。這種潛伏性感染之所以產(chǎn)生是因?yàn)镠IV DNA能夠持續(xù)存在于CD4+記憶T細(xì)胞的基因組中和可能其他的細(xì)胞儲存庫中,在那里,HIV病毒保持潛伏狀態(tài),不受當(dāng)前療法的影響。

在早前的研究(Scientific Reports, doi:10.1038/srep22555)中,Khalili博士和同事們能夠證實(shí)他們基于CRISPR/Cas9技術(shù)的新基因編輯系統(tǒng)在體外能夠很好地從被感染的細(xì)胞中清除HIV-1,而且對宿主細(xì)胞沒有任何副作用。在針對臨床樣品---包括來自HIV感染者的T細(xì)胞在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)時(shí)增殖---的體外實(shí)驗(yàn)中,他們證實(shí)在經(jīng)這種基因編輯系統(tǒng)治療后,病毒復(fù)制顯著降低(詳細(xì)新聞報(bào)道參見:Nature子刊:利用CRISPR/Cas9清除人T細(xì)胞基因組中的HIV-1)。

這項(xiàng)研究的設(shè)計(jì)目的是專門測試這種基因編輯技術(shù)是否也能夠清除轉(zhuǎn)基因大鼠和小鼠體內(nèi)的HIV-1,其中HIV DNA已被整合進(jìn)這兩種實(shí)驗(yàn)性轉(zhuǎn)基因動物的每個(gè)器官每個(gè)細(xì)胞的基因組中。為了讓這種基因編輯技術(shù)應(yīng)用于活動物體內(nèi)的細(xì)胞中,Khalili博士和同事們使用重組腺相關(guān)病毒(rAAV)載體運(yùn)送系統(tǒng)。他們也對這種基因編輯系統(tǒng)進(jìn)行基因改造以便能夠切割整合到宿主細(xì)胞基因組中的HIV-1 DNA,從而導(dǎo)致病毒DNA片段從宿主基因組中切除。

在利用rAAV載體運(yùn)送系統(tǒng)將 CRISPR/Cas-9分子運(yùn)送到這兩種轉(zhuǎn)基因動物的血液中兩周后,研究人員分析了從這些動物體內(nèi)收集的組織中的HIV-1 DNA。分析結(jié)果證實(shí)在包括大腦、心臟、腎臟、肝臟、肺部和脾臟在內(nèi)的每個(gè)組織中以及血細(xì)胞中,HIV-1 的特定DNA片段都被從病毒基因組中切除。在分析模式大鼠體內(nèi)的病毒RNA時(shí),研究人員證實(shí)這一策略顯著地降低循環(huán)淋巴細(xì)胞和淋巴結(jié)中的HIV-1 RNA水平,這就表明病毒基因組片段切除顯著地影響攜帶整合性病毒DNA的細(xì)胞中的HIV-1基因表達(dá)。

Khalili博士說,“這種rAAV運(yùn)送系統(tǒng)進(jìn)入含有HIV-1基因組的很多器官中并對病毒DNA進(jìn)行基因編輯的能力是這種策略也能夠克服潛在性HIV感染的細(xì)胞中的病毒再激活的重要指標(biāo)。它充當(dāng)著一種潛在地治療HIV感染者的方法。”用于這項(xiàng)研究中的這種切除策略導(dǎo)致HIV-1 DNA的較大片段被切除,也就消除了在進(jìn)行治療時(shí)任何可復(fù)制性HIV病毒逃避事件出現(xiàn)的可能性。

這項(xiàng)新研究的臨床影響是深遠(yuǎn)的。這種基因編輯平臺本身可能能夠*病人體內(nèi)的HIV-1 DNA,但是它也是高度靈活的,可能能夠潛在地與現(xiàn)存的抗逆轉(zhuǎn)錄病物組合使用從而進(jìn)一步抑制病毒RNA復(fù)制。它可能也能夠經(jīng)改造后靶向作用于發(fā)生突變的HIV-1毒株。

Khalili博士注意到在未來幾年,基于這種方法的臨床試驗(yàn)可能會開展。與此同時(shí),下一步就是在更大的動物群體中開展追蹤研究,在這項(xiàng)追蹤研究中,研究人員計(jì)劃監(jiān)控這種治療方法的療效、安全性和其他的重要指標(biāo)。

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