、 鮭魚(yú)傳染性貧血病毒(ISAV)熒光 RT-PCR 檢測(cè)試劑盒簡(jiǎn)介
貨號(hào):HB-705-
鮭魚(yú)傳染性貧血癥, 英文名: Infectious Salmon Anaemia,簡(jiǎn)稱 ISA。它的主要癥狀是嚴(yán)重貧
血,受感染后的鮭魚(yú)大約在 2-3 周后死亡。不同的鮭魚(yú)對(duì) ISA 病毒有不同的敏感性,主要體征表現(xiàn)
為魚(yú)眼球突出,腹腔積水,腹部器官出血,有時(shí)也會(huì)發(fā)生在皮膚上。肝臟或腎臟局部組織死亡。癥
狀的特征是貧血、腹水、脾腫大和在眼、皮膚和腹膜出血。實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證明,虹鱒,褐鱒魚(yú)和鮭魚(yú)可
能是 ISA 病毒無(wú)癥狀攜帶者。
為了適應(yīng)鮭魚(yú)傳染性貧血癥病毒(ISAV)快速檢測(cè)和疫病研究的需要,本公司參考 205 年 OIE
水生動(dòng)物疾病診斷手冊(cè) 2.3.5 中規(guī)定的引物和探針序列,經(jīng)多次實(shí)驗(yàn)及系統(tǒng)優(yōu)化,開(kāi)發(fā)了本試
劑盒。應(yīng)用本試劑盒進(jìn)行檢測(cè)具有快速、靈敏、特異、準(zhǔn)確、安全操作簡(jiǎn)單、應(yīng)用廣泛和高通量檢
測(cè)等特點(diǎn)及優(yōu)點(diǎn)。
2、 試劑盒組成
試劑盒組成包括核酸擴(kuò)增試劑。具體組成參見(jiàn)表 :
表 :試劑盒組成(50test/盒)
試劑盒組成成分 體積
核酸提取試劑: 核酸裂解液 5ml×2 管
核酸擴(kuò)增試劑: DEPC 水
ISAV 熒光 RT-PCR 反應(yīng)液
酶混合物
陰性對(duì)照
ISAV 熒光陽(yáng)性對(duì)照
ml× 管
750µL× 管
60µL× 管
ml× 管
ml× 管
(注:核酸提取試劑可使用本公司的提取核酸更快捷方便的《病毒 RNA 柱式提取試劑盒》)
3、 樣本采集,存放及運(yùn)輸
3. 樣本采集:所用取樣器材必須經(jīng)高壓滅菌并烘干。
取新鮮魚(yú)類(lèi)組織臟器(肝、腦、脾、腎)2g 于已洗凈、滅菌并烘干的研缽中充分研磨,加 5ml PBS混勻,2 000r/min 離心 0min 取上清轉(zhuǎn)入無(wú)菌離心管中備用?;蛉∮锌梢杉?xì)胞病變的細(xì)胞懸液用于檢測(cè)。
3.2 存放:研磨后的樣本在 2 ℃—8 ℃條件下保存應(yīng)不超過(guò) 24 h;-70 ℃以下可保存,但應(yīng)避免反復(fù)凍融(zui多凍融 3 次)。
3.3 運(yùn)輸:采用泡沫箱加冰密封進(jìn)行運(yùn)輸。4、 熒光 RT-PCR 檢測(cè)
4. 操作方法
4.. 樣本的處理(在樣本制備區(qū)進(jìn)行):
4... 取 n 個(gè)滅菌的 .5 mL Eppendorf 管,其中 n 為被檢樣品與陰性對(duì)照的和(陽(yáng)性對(duì)照、陰性
對(duì)照在試劑盒中已標(biāo)出),做標(biāo)記。
(注:試劑盒中的陽(yáng)性對(duì)照直接作為一步法RT-PCR檢測(cè)的模板,無(wú)需提取核酸)
4...2 每管加入 600 µL 裂解液,分別加入被檢樣本和陰性對(duì)照各 200 µL,一份樣本換用一個(gè)吸
頭,混勻器上振蕩混勻 5 s(不能過(guò)于強(qiáng)烈,以免產(chǎn)生乳化層,也可以用
手顛倒混勻),于 4℃ 2 000 r/min 離心 5 min。
4...3 取與 4... 相同數(shù)量滅菌的 .5 mL Eppendorf 管,加入 500 µL 異丙醇(-20℃預(yù)冷),
做標(biāo)記。吸取 4...2 各管中的上清液轉(zhuǎn)移至相應(yīng)的管中,上清液應(yīng)至少吸取 500µL,不能吸
出中間層,顛倒混勻。
4...4 于 4 ℃、2 000 r/min 離心 5 min(Eppendorf 管開(kāi)口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),小
心倒去上清,倒置于吸水紙上,沾干液體(不同樣品須在吸水紙不同地方沾干);加入 600 µL 75%
乙醇,顛倒洗滌。
4...5 于 4 ℃、2 000 r/min 離心 0 min(Eppendorf 管開(kāi)口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),小
心倒去上清,倒置于吸水紙上,盡量沾干液體(不同樣品須在吸水紙不同地方沾干)。
4...6 4 000 r/min 離心 0s(Eppendorf 管開(kāi)口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),將管壁上的殘余液體甩到管底部,小心倒去上清,用微量加樣器將其吸干,一份樣本換用一個(gè)吸頭,吸頭不要碰到有沉淀一面,室溫干燥 3 min,不能過(guò)于干燥,以免 RNA 不溶。
4...7 加入 µL DEPC 水,輕輕混勻,溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 離心 5 s,冰上保存?zhèn)溆?。提取?RNA 須在 2 h 內(nèi)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增;若需保存須放置-70 ℃冰箱內(nèi)。
【也可參照《病毒 RNA 柱式提取試劑盒說(shuō)明書(shū)》(貨號(hào):HB-QPCR-0)使用,更方便快捷提取
核酸】。
注:提取的 RNA 須在 2 h 內(nèi)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增;若需保存須放置-70 ℃冰箱內(nèi)。
4..2 鮭魚(yú)傳染性貧血病毒(ISAV)熒光 RT-PCR 檢測(cè)試劑盒檢測(cè)
4..2. 擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備(在反應(yīng)混合物配制區(qū)進(jìn)行):
從試劑盒中取出相應(yīng)的熒光 RT-PCR 反應(yīng)液、酶混合物,在室溫下融化后,2000 r/min 離心 5 s。
設(shè)所需熒光 RT-PCR 檢測(cè)總數(shù)為 n,其中 n 為被檢樣品、陽(yáng)性對(duì)照與陰性對(duì)照的和,每個(gè)樣品測(cè)試反應(yīng)體系配制見(jiàn)表 2:
表 2 每個(gè)樣品測(cè)試反應(yīng)體系配制表
試劑 RT-PCR 反應(yīng)液 酶混合物
用量 5 μL .0 μL
根據(jù)測(cè)試樣品的數(shù)量計(jì)算好各試劑的使用量,加入到適當(dāng)體積試管中,充分混合均勻,向每個(gè)熒光RT-PCR管中各分裝6 µL,轉(zhuǎn)移至樣本處理區(qū)。
4..2.2 加樣(樣本處理區(qū)進(jìn)行):
在各設(shè)定的熒光RT-PCR管中分別加入上述樣本處理步驟4...7中制備的RNA溶液各0 µL,蓋緊管蓋,500 r/min離心30 s。4..2.3 熒光 RT-PCR 檢測(cè)(在檢測(cè)區(qū)進(jìn)行):
將4..2.2中離心后的PCR管放入熒光RT-PCR檢測(cè)儀內(nèi),記錄樣本擺放順序。
循環(huán)條件設(shè)置:
*階段,反轉(zhuǎn)錄42 o
C /30 min;
第二階段,預(yù)變性92 o
C/3 min;
第三階段,92 o
C/0s,60 o
C/30s,72 o
C/20s,40個(gè)循環(huán),在第三階段每次循環(huán)的60 o
C退火延
伸時(shí)收集熒光。
試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)束后,根據(jù)收集的熒光曲線和Ct值判定結(jié)果。
4.2 結(jié)果判定
4.2. 結(jié)果分析條件設(shè)定
直接讀取檢測(cè)結(jié)果。閾值設(shè)定原則根據(jù)儀器噪聲情況進(jìn)行調(diào)整,以閾值線剛好超過(guò)正常陰性樣品擴(kuò)增曲線的zui高點(diǎn)為準(zhǔn)。
4.2.2 質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
4.2.2. 陰性對(duì)照的 Ct 值應(yīng)<28.0,并出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線。否則,此次實(shí)驗(yàn)視為無(wú)效。
4.2.3 結(jié)果描述及判定
4.2.3. 陰性
無(wú)Ct值或無(wú)擴(kuò)增曲線,示樣品中無(wú)ISAV核酸。
4.2.3.2 陽(yáng)性
Ct值≤30,且出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,示樣品中存在ISAV核酸。
4.2.3.3 有效原則
Ct值>30的樣本建議重做。重做結(jié)果無(wú)數(shù)值者為陰性,否則為陽(yáng)性。
5、 鮭魚(yú)傳染性貧血病毒(ISAV)熒光 RT-PCR 檢測(cè)試劑盒相關(guān)技術(shù)信息(引物和探針序列)
5’-CTA-CAC-AGC-AGG-ATG-CAG-ATG-T-3’
5’-CAG-GAT-GCC-GGA-AGT-CGA-T-3’
5’-6FAM-CAT-CGT-CGC-TGC-AGT-TC-MGBNFQ-3’