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技術(shù)文章

Nature發(fā)現(xiàn)備用遺傳操作指令

閱讀:458發(fā)布時間:2014-7-10

利用在HIV感染中起至關(guān)重要作用的一種基因展開研究,馬里蘭大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)某些人類基因具有一套備用操作指令,其寫入在它們的蛋白質(zhì)制造機器中。備用指令可迅速地改變蛋白質(zhì)的成分、功能以及生存的能力。
這一稱作為程序性核糖體移碼(programmed ribosomal frameshifting)的現(xiàn)象,是在1985年于病毒中被發(fā)現(xiàn)。資深作者、馬里蘭大學(xué)細胞生物學(xué)與分子遺傳學(xué)教授Jonathan Dinman說,發(fā)表在7月9日《自然》(Nature)雜志上的這項研究,*次證實了人類基因利用程序性核糖體移碼來改變其組裝蛋白質(zhì)的方式。
在Dinman和同事們研究的這一免疫系統(tǒng)相關(guān)基因中,程序性核糖體移碼觸動了一個過程,機體利用它來清除某些免疫分子,從而控制發(fā)燒、炎癥和器官衰竭等潛在有害副作用。Dinman說,這一研究發(fā)現(xiàn)有可能促成更好地治療艾滋病、過敏和移植器官的排斥反應(yīng)。
“當(dāng)你想關(guān)閉機體某部分的免疫反應(yīng)或免疫反應(yīng)的一個方面,而不觸及另一部分或另一方面時,這具有重要的意義。它有可能促成非常特異的、*的治療方法,”Dinman說。
核糖體是存在于每個活細胞中的蛋白質(zhì)工廠,將氨基酸聚集到一起,組裝成蛋白質(zhì)鏈生成細胞所需的幾乎所有東西。信使RNA鏈?zhǔn)悄0?。三個核苷酸為一組代表一個氨基酸;其被稱之為三聯(lián)體密碼子。特異的轉(zhuǎn)運RNA分子“讀取”每個密碼子,將匹配的氨基酸遞送至核糖體進行裝配。一些密碼子充當(dāng)了終止標(biāo)志,指示核糖體釋放完成的蛋白質(zhì)鏈(延伸閱讀:Cell:拯救受困的細胞工廠 )。
想象一下信使RNA就是由三個字母的單詞(密碼子)、空格和標(biāo)點符號(終止密碼子)構(gòu)成的一個文本。
為了按正確的順序組裝蛋白,核糖體必須讀取每個密碼子、空格和終止密碼子所有三個部分。但有時候信使RNA包含的一些信息,可以重編程核糖體向前或向后跳躍一個或兩個位置——轉(zhuǎn)換閱讀框。這會改變文本。現(xiàn)在轉(zhuǎn)運RNA讀取新的命令生成了*不同的蛋白質(zhì),或是無義RNA。
移碼信號常見于一些病毒中,病毒利用它們來將多套命令塞入到一個RNA鏈中。很早以前Dinman就懷疑人類細胞也有移碼信號,并且它們是有用的。
自上世紀(jì)90年代以來Dinman一直在研究核糖體移碼。Dinman說:“這些都是非常復(fù)雜的RNA結(jié)構(gòu),在人類細胞中尋找它們需要大量的計算機內(nèi)存。直到過去10年,計算機才足夠快速及強大可用于尋找這些信號。”
Dinman和主要作者Ashton Trey Belew對人類白細胞表面的CCR5基因展開了研究。CCR5對于免疫系統(tǒng)極為重要,某些形式的HIV就利用它來進入健康細胞。
研究人員發(fā)現(xiàn)了CCR5中充當(dāng)移碼信號的一種分子模式。針對人類活細胞和兔細胞提取物進行測試,他們發(fā)現(xiàn)這一信號提示了核糖體移碼。利用質(zhì)譜法,他們證實移碼發(fā)生在CCR5內(nèi)部預(yù)測是移碼信號的序列上。隨后,他們搜索了另一實驗室發(fā)布的人類核糖體數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)了確鑿的證據(jù)證實移碼以大概相同的速度發(fā)生于那一點。
他們還發(fā)現(xiàn),稱作為microRNA-1224的小RNA片段將自身附著到了CCR5信使RNA的移碼位置。這一microRNA拉緊信使RNA,使得它不易彎曲,使得核糖體終止在那里,并經(jīng)常滑過一兩個位置。
Dinman說:“什么調(diào)控了移碼?一直是ttg該領(lǐng)域zui大的一個問題。實際上這就是microRNA-1224正在做的事情。那隨后問題就變成了,其會造成什么后果?”
就CCR5而言,移碼將它背后的密碼子轉(zhuǎn)變?yōu)榱藷o義RNA。由于核糖體不能讀取它們,細胞的其他元件會介入并破壞信使RNA及其相關(guān)蛋白。
這或許看起來像一件壞事。但是我們機體的免疫反應(yīng)會引起諸如發(fā)燒等一些癥狀。免疫反應(yīng)偶爾失控,會引起一些嚴重的、有時是致命的副作用。
Dinman認為,通過消除信使RNA和大量免疫系統(tǒng)蛋白,移碼發(fā)揮了調(diào)光開關(guān)的作用,將免疫反應(yīng)降低到安全水平。


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