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公司動(dòng)態(tài)

單個(gè)噬菌體插入?yún)^(qū)域PCR產(chǎn)物的測(cè)序

閱讀:573發(fā)布時(shí)間:2010-8-4

[器材和試劑]
● ABl 377型測(cè)序儀
● ABI的BigDye染液
● ABl 9700型PCR儀器
● ABI藍(lán)色葡聚糖/EDTA上樣緩沖液
● 3mol/L的乙酸鈉
● 95%及70%的乙醇
● 0.4pmol/ul的fUSE5“超級(jí)反向”引物,或T7“超級(jí)上游”引物
● 一臺(tái)帶Qiagen 2X 96平板轉(zhuǎn)子或同等轉(zhuǎn)子的Qiagen 4K15C型離心機(jī)

[方法]
1.將測(cè)序反應(yīng)成分混合于10ul的反應(yīng)體積中:1.5ul來(lái)自PCR擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物, 2.5ul的MilliQ純水,2.0ul濃度為0.4pmol/ul的{USE5“超級(jí)反向”引物或T7“超級(jí)上游”引物(共0.8pmol),4.0ul的Big Dye染液。
2.在以下條件下完成熱循環(huán):94℃放置2分鐘;分別在3個(gè)溫度下進(jìn)行PCR,進(jìn)行30次循環(huán),分別是96℃下45秒、50℃下20秒以及60℃下3分鐘;放置在4℃下直到準(zhǔn)備純化為止。
3.向10ul的測(cè)序反應(yīng)體系中加入1ul 3mol/L乙酸鈉和25ul 95%乙醇。
4.在-20℃下孵育60分鐘以沉淀產(chǎn)物。
5.在帶Qiagen 2X 96平板轉(zhuǎn)子或同等轉(zhuǎn)子的Qiagen 4K15C型離心機(jī)中,6000r/min(5788g) 離心20分鐘。
6.迅速翻轉(zhuǎn)96孔板,并將乙醇輕輕甩出。
7.用125ul的70%乙醇洗滌。
8.在帶Qiagen 2X96平板轉(zhuǎn)子或同等轉(zhuǎn)子的Qiagen 4K15C型離心機(jī)中,6000r/mln離心5分鐘。
9.迅速翻轉(zhuǎn)96孔板,并將乙醇輕輕甩出。
10.在一個(gè)96孔加熱板上干燥15分鐘。
11.將樣品懸浮于1.5ul的ABI藍(lán)色葡聚糖/EDTA上樣緩沖液中。
12.每份樣品取0.8ul上樣到一塊預(yù)制的聚丙烯酰胺測(cè)序膠上,并在ABl 377測(cè)序儀上跑3.5小時(shí)。
13.用序列分析軟件來(lái)分析數(shù)據(jù),如SequencherTM(GeneCodesCorp)。

 


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