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閱讀:427發(fā)布時(shí)間:2016-1-21
DNA條形碼技術(shù)(DNA Barcoding)近年來(lái)已成為上生物多樣性研究的熱點(diǎn),即利用標(biāo)準(zhǔn)基因片段對(duì)物種進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的鑒定和識(shí)別。該技術(shù)正廣泛應(yīng)用于生物多樣性調(diào)查、分子進(jìn)化、生態(tài)、環(huán)境、食品安全等諸多領(lǐng)域。
在脊椎動(dòng)物中,目前魚(yú)類(lèi),鳥(niǎo)類(lèi),以及極地動(dòng)物在DNA條形碼研究中進(jìn)展較快,已有大量相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)在線。作為重要類(lèi)群之一的兩棲爬行動(dòng)物,進(jìn)展一直較為緩慢。在對(duì)兩棲類(lèi)的研究中,歐洲學(xué)者探討了DNA條形碼的鑒別能力,結(jié)果表明COI基因在該類(lèi)群中鑒別物種方面是適合的,但是由于COI基因進(jìn)化速率較快,序列保守性相對(duì)低,引物通用性差,極大阻礙了在兩棲類(lèi)群中開(kāi)展相關(guān)工作。
中科院昆明動(dòng)物所車(chē)靜副研究員以及學(xué)生陳宏滿和楊軍校等人在張亞平院士的指導(dǎo)下,重新設(shè)計(jì)和優(yōu)化了兩對(duì)COI通用兼并引物,在中國(guó)兩棲類(lèi)的11個(gè)科、36個(gè)屬、82個(gè)種111個(gè)個(gè)體中進(jìn)行了驗(yàn)證,證實(shí)新設(shè)計(jì)的兩對(duì)引物能夠較廣泛的用于兩棲類(lèi)DNA條形碼研究。該結(jié)果目前已在線發(fā)表Molecular Ecology Resources。該引物目前在爬行類(lèi)群測(cè)試中也得到很好的驗(yàn)證。
兩棲爬行類(lèi)是動(dòng)物界中*的一支,尤其兩棲類(lèi)代表由水到陸的轉(zhuǎn)型過(guò)渡物種,對(duì)環(huán)境變化極為敏感,一直是研究環(huán)境和氣候變化的指示物種。針對(duì)兩棲爬行類(lèi)DNA條形碼工作不足的現(xiàn)狀,昆明動(dòng)物所于第四屆生命條形碼大會(huì)上提出兩棲爬行動(dòng)物DNA條形碼“Cold Code”計(jì)劃,致力于在范圍內(nèi)領(lǐng)導(dǎo)兩棲爬行類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)記基因篩選、技術(shù)體系構(gòu)建、標(biāo)準(zhǔn)文庫(kù)建設(shè)等方面發(fā)揮重要作用
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