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上海永葉生物科技有限公司
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閱讀:343發(fā)布時(shí)間:2016-1-6
人體腸道菌群研究近年來(lái)掀起了一股熱潮。許多研究將這些我們體內(nèi)的微生物與各種各樣的疾病起來(lái),如肥胖,糖尿病,還有癌癥等等,人們也對(duì)腸道菌群治療的前景產(chǎn)生了美好的遐想。然而應(yīng)該說(shuō)對(duì)于這些還處于臨產(chǎn)前階段的研究成果,大多數(shù)還是“炒作”,尤其當(dāng)一些公司參與進(jìn)來(lái)的時(shí)候。
那么什么時(shí)候這些炒作能真正變成我們治療疾病的新希望呢,12月Cell雜志上的綜述“From Hype to Hope: The Gut Microbiota in Enteric Infectious Disease”圍繞這一方面展開(kāi)了探討,指出人體腸道微生物目前zui清楚的功能之一就是能抵抗腸道病原體在腸道中的侵占,因此重建微生物群將是一種很有希望的治療方法,但是這面臨著很大的挑戰(zhàn)。
細(xì)菌遍布于我們的生活當(dāng)中,人體微生物測(cè)序研究的*個(gè)十年令我們了解到這種微小的生物在我們生活中占據(jù)了多大的份量,整個(gè)生物學(xué)領(lǐng)域,譬如生理學(xué)、免疫學(xué)和行為學(xué)都有它的身影。而對(duì)于腸道傳染疾病來(lái)說(shuō),我們對(duì)可以作為病原體屏障的腸道菌群的了解也日益加深。
科學(xué)家們現(xiàn)在知道了腸道菌群能主動(dòng)參與疾病的預(yù)防和發(fā)生,這不禁令他們想到,如果能將丟失的微生物送回腸道中,是否就能趕走病原體,平衡系統(tǒng),防止疾病。
2007年,美國(guó)NIH宣布將投入1億1500萬(wàn)美元正式啟動(dòng)醞釀了兩年之久的“人類微生物組計(jì)劃”,包括中國(guó)在內(nèi)的十幾個(gè)國(guó)家計(jì)劃使用新一代DNA測(cè)序儀進(jìn)行人類微生物組DNA的測(cè)序工作,此后陸續(xù)有成果出來(lái),比如2010年,華大基因研究院王俊與法國(guó)國(guó)立研究中心的S.Dusko*的研究小組首先完成了人體腸道菌群元基因組參考基因集的構(gòu)建工作。
當(dāng)時(shí)課題稱為“人類小腸元基因組學(xué)”項(xiàng)目,簡(jiǎn)稱為MetaHIT。研究人員從丹麥和西班牙124位健康的、超重的和肥胖的成年人以及炎癥患者提取的人腸道微生物菌落的一個(gè)基因目錄。所獲數(shù)據(jù)為了解這一基因組(比人類基因組大150倍)提供了*手資料,并且表明這些基因大部分是在不同個(gè)體之間共享的。根據(jù)由這些基因所編碼的各種不同功能,研究人員就有可能來(lái)確定zui小的腸道元基因組和zui小的腸道細(xì)菌基因組。
治療急性傳染病
研究表明,抗生素會(huì)破壞腸道里的微生態(tài)系統(tǒng),但一般我們都會(huì)認(rèn)為這只是一個(gè)短期的改變,zui終總會(huì)恢復(fù)。然而2010年的一項(xiàng)研究表明,抗生素可以導(dǎo)致人腸道中定居細(xì)菌的*改變。由于腸道菌群的改變會(huì)增加一些慢性疾病的風(fēng)險(xiǎn),因此每個(gè)療程的抗生素治療都可能是短期收益與*風(fēng)險(xiǎn)的博弈。
比如艱難梭狀芽胞桿菌C. difficile就是zui常見(jiàn)的一種造成抗生素腸道菌群傷害的微生物,每年大約會(huì)出現(xiàn)25萬(wàn)起病例。在過(guò)去10年里艱難梭狀芽胞桿菌引起了較大的感染流行率,該菌引發(fā)的感染往往很難治療,而且其使患者常常發(fā)生腹瀉、腹痛及惡心等癥狀。
去年的一項(xiàng)研究表明,如果往小鼠胃腸道(GI)加入擬桿菌屬細(xì)菌,能產(chǎn)生特異性酶,有助于保護(hù)好的共生細(xì)菌免于受抗生素的有害影響。
這些擬桿菌屬細(xì)菌產(chǎn)生的酶,即β-內(nèi)酰胺酶是抗生素耐藥性的重要原因,這種酶不僅保護(hù)產(chǎn)生β-內(nèi)酰胺酶的細(xì)菌,同時(shí)也保護(hù)腸道微生物細(xì)菌種群中的其余部分細(xì)菌。研究人員建立了腸道中有生成β-內(nèi)酰胺酶的桿菌種群的小鼠,然后他們給所有小鼠服用*(β-內(nèi)酰胺抗生素)三天,然后口服給予*耐藥腸球菌,或C. difficile,結(jié)果顯示這有可能在服用抗生素的同時(shí),避免腸道微生物的損失,避免病原體增殖。
同時(shí),另外一項(xiàng)研究表明,糞便移植對(duì)于治療免疫受損病人艱難梭狀芽胞桿菌的感染有效且安全。研究人員利用糞便移植治療了許多免疫受損患者,而且研究人員正在尋找如何來(lái)描述免疫受損個(gè)體經(jīng)過(guò)治療的感染*;通過(guò)綜合分析研究者表示,糞便移植的總體*可以達(dá)到89%,在糞便治療的個(gè)體中有12位病人在治療12周內(nèi)發(fā)生了嚴(yán)重的副作用,其中有2位病人死亡,一人死于*檢查過(guò)程中,另一位的死亡和糞便移植療法并無(wú)關(guān)聯(lián)。
這種所謂的糞便移植方法(fecal microbiota transplantation,F(xiàn)MT)簡(jiǎn)單的說(shuō)是將健康者的糞便導(dǎo)入腸道受感染的患者以抑制患者體內(nèi)有害細(xì)菌滋生的治療措施。
在Nature上的一篇論文:Precision microbiome reconstitution restores bile acid mediated resistance to Clostridium difficile中,研究人員對(duì)小鼠和人類的腸道菌群進(jìn)行了測(cè)序,以尋找能夠消除感染的細(xì)菌物種。他們發(fā)現(xiàn)在抗生素治療的小鼠中,抵抗艱難梭菌感染與C. scindens以及較小程度上另外的10種細(xì)菌種類強(qiáng)相關(guān)。對(duì)接受干細(xì)胞移植操作、使得他們?nèi)菀资艿狡D難梭菌感染的人類患者的腸道菌群進(jìn)行類似研究,還指出了C. scindens是抵抗感染zui有力的資源。
給予接受抗生素治療的艱難梭菌感染小鼠C. scindens,可顯著提高生存率顯著達(dá)到80%,而對(duì)照物質(zhì)則只有50%。C. scindens加上三個(gè)艱難梭菌抑制菌組成的一種雞尾酒增加有效,導(dǎo)致了*的生存。此外,C. scindens和細(xì)菌雞尾酒的豐度與抵抗力顯著相關(guān)。
也許這種被不少人稱為“吃屎療法”的方法會(huì)讓你覺(jué)得惡心,但其實(shí)有不少中草藥就是動(dòng)物糞便所制作,如望月砂等,所以說(shuō)這也許未來(lái)就是一種頗具潛力的新治療方法。
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