2013年7月12日，美國(guó)杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院、多倫多兒童醫(yī)院以及深圳華大基因研究院等多家單位通過(guò)全基因組測(cè)序的方法成功鑒定出一系列與自閉癥相關(guān)的遺傳突變和風(fēng)險(xiǎn)基因。該研究成果在《美國(guó)人類(lèi)遺傳學(xué)》（the American Journal of Human Genetics）上發(fā)表，為自閉癥研究提供了寶貴的遺傳資源，同時(shí)或?qū)⒊蔀樘剿髯蚤]癥病理機(jī)制及開(kāi)發(fā)新的治療手段極為關(guān)鍵的一步。

人們稱(chēng)自閉癥兒童為“星星的孩子”。自閉癥又稱(chēng)孤獨(dú)癥，是一種由于神經(jīng)系統(tǒng)失調(diào)而導(dǎo)致的發(fā)育障礙。每20分鐘就有一個(gè)孩子被診斷為自閉癥，目前自閉癥患者已達(dá)6700萬(wàn)。中國(guó)的自閉癥患兒也已經(jīng)超過(guò)100萬(wàn)，且患病率逐年上升。自閉癥的主要病癥包括不正常的社交能力、溝通能力、興趣及行為模式，其病因尚不明確，但發(fā)現(xiàn)自閉癥表現(xiàn)出很高的可遺傳性及家族聚集性，但由于其臨床和基因組學(xué)異質(zhì)性，其遺傳基礎(chǔ)目前尚不清楚。

全基因組測(cè)序能夠?yàn)殍b定自閉癥的新的風(fēng)險(xiǎn)基因以及新生突變提供有價(jià)值的信息，但是目前尚未有從全基因組水平對(duì)自閉癥做出全面評(píng)價(jià)。因此，在這項(xiàng)研究中，研究人員對(duì)32個(gè)自閉癥家系進(jìn)行了全基因組測(cè)序研究，并在全基因組范圍內(nèi)對(duì)單堿基突變（SNV）、拷貝數(shù)變異（CNV）以及插入/缺失（indel）等進(jìn)行檢測(cè)，用以鑒定與自閉癥相關(guān)由于功能缺失或錯(cuò)義變化而有害的新生突變或罕見(jiàn)的遺傳性突變。

研究人員在自閉癥先證者中鑒定出19%的新生突變以及31%的伴X染色體或常染色體遺傳性變異。所鑒定出的純系突變比例高于以往的研究報(bào)道，這表明全基因組測(cè)序更全面的覆蓋到所有位點(diǎn)，同時(shí)本研究還進(jìn)行了外顯子測(cè)序，相比之下，全基因組測(cè)序能夠更好的對(duì)與自閉癥相關(guān)的基因進(jìn)行檢測(cè)。

在這項(xiàng)研究中，研究人員共在9個(gè)過(guò)去已知的與自閉癥相關(guān)的基因、4個(gè)新發(fā)現(xiàn)的自閉癥基因以及8個(gè)候選自閉癥風(fēng)險(xiǎn)基因上鑒定出有害的突變。比如與FMR1相配位參與脆性X染色體綜合征的CAPRIN1和AFF2，與社會(huì)認(rèn)知缺陷相關(guān)的VIP基因，能夠造成與自閉癥相關(guān)的CHARGE綜合征的CHD7基因以及SCN2A、KCNQ2、NRXN1等。

研究還指出，自閉癥全基因組測(cè)序的結(jié)果可能有助于自閉癥的早期診斷。比如，攜帶有諸如SCN2A和CAPRIN1等新生突變的先證者家族中，后代中再次發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)和其他群體相似；而攜帶有一些罕見(jiàn)遺傳變異，如CACNA1C、CHD7、KCNQ2，則出現(xiàn)自閉癥的風(fēng)險(xiǎn)較大。同時(shí)伴X連鎖基因發(fā)生突變也解釋了自閉癥患者中男性患者居多。此外，所鑒定出的遺傳突變也是很多藥物設(shè)計(jì)的潛在分子靶點(diǎn)，能夠?yàn)樽蚤]癥的個(gè)性化治療打開(kāi)大門(mén)，比如VIP基因、KCNQ2等。

華大科技總裁李英睿表示，“全基因組測(cè)序是一種強(qiáng)有力的工具，可以加速開(kāi)發(fā)新的診斷和治療手段，從而改善自閉癥患者及其家庭的生活。自閉癥的早期診斷非常重要，有助于患有自閉癥的兒童在語(yǔ)言和社會(huì)能力上獲得顯著改善。”

據(jù)了解，本研究為由華大基因和美國(guó)自閉癥之聲（Autism Speaks）聯(lián)合的“10,000個(gè)自閉癥基因組研究計(jì)劃”（/）的前期項(xiàng)目。該計(jì)劃由來(lái)自19個(gè)國(guó)家的50多個(gè)研究機(jī)構(gòu)所參與。*階段的目標(biāo)是完成200名自閉癥兒童及其父母的基因組學(xué)研究，目前已經(jīng)完成了99個(gè)加拿大家系的測(cè)序。

目前，華大基因旗下子公司——深圳華大健康科技有限公司已正式推出“自閉癥基因檢測(cè)”服務(wù)，其主要有2種自閉癥基因檢測(cè)的方法，即目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序和全基因組測(cè)序。通過(guò)自閉癥基因檢測(cè)，可以尋找與疾病相關(guān)的突變位點(diǎn)，從基因水平上提供自閉癥的直接證據(jù)，并進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估，為臨床診斷和早期干預(yù)與治療提供科學(xué)依據(jù)。            來(lái)源：華大基因