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TRIzol影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果?miRNA文章被撤回

時(shí)間:2012-11-19閱讀:191
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    研究小組近日撤回了一篇關(guān)于microRNA(miRNA)衰減的文章,因?yàn)樗齻儼l(fā)現(xiàn),所用的TRIzol試劑會(huì)對(duì)富含GC的miRNA或具二級(jí)結(jié)構(gòu)的miRNA產(chǎn)生不同影響。 研究人員發(fā)現(xiàn),一旦細(xì)胞粘附性喪失,某些miRNA迅速降解。當(dāng)他們以低密度培養(yǎng)細(xì)胞或用*或EGTA解離細(xì)胞時(shí),細(xì)胞內(nèi)成熟miR-141表達(dá)水平顯著下降,而來(lái)自同一個(gè)轉(zhuǎn)錄本(pri-miR-200c~141)的miR-200c不受影響。當(dāng)細(xì)胞解離時(shí),*對(duì)轉(zhuǎn)錄的阻斷導(dǎo)致miR-141的迅速耗盡,半衰期不到1小時(shí),從而表明miR-141是通過(guò)高速衰減而導(dǎo)致表達(dá)水平發(fā)生迅速改變的。在進(jìn)一步的研究中,研究人員通過(guò)其他的miRNA包括miR-200a, miR-34a, miR-29b, miR-301a, 和 miR-21再次驗(yàn)證了這一調(diào)控機(jī)制.然而,Narry Kim研究小組近日撤回了該文章。她們?cè)诔坊芈暶髦袑?xiě)道:“基于我們的結(jié)果,我們認(rèn)為,一些miRNA會(huì)根據(jù)細(xì)胞的粘附狀態(tài)而選擇性喪失穩(wěn)定性。然而,在后續(xù)研究中,我們發(fā)現(xiàn),低GC含量的miRNA(如miR-141、miR-29b、miR-21、miR-106b、miR-1和miR-34a)會(huì)在樣品制備階段選擇性丟失,而不是在細(xì)胞中降解。”

    此外,Kim及她的同事還發(fā)表了新的數(shù)據(jù),將TRIzol RNA分離方法與另一種不太常用的mirVana方法進(jìn)行了比較,應(yīng)用在高密度和低密度細(xì)胞樣品上。利用TRIzol,她們發(fā)現(xiàn),低密度培養(yǎng)物中的miR-141水平低于高密度培養(yǎng)物。然而,利用mirVana方法,兩者只有輕微的差異。作者認(rèn)為,兩個(gè)操作步驟的數(shù)據(jù)不一致提出了一個(gè)嚴(yán)重的問(wèn)題,即某些miRNA可能在RNA制備過(guò)程中丟失,這取決于選擇的操作步驟。 Kim談道:“科學(xué)家不可避免地會(huì)承認(rèn)一些假設(shè),而它們后來(lái)被證明是錯(cuò)誤的。我們也存在一些技術(shù)限制,而在研究的時(shí)候未被發(fā)現(xiàn)。因此,得出錯(cuò)誤的結(jié)論有時(shí)是不可避免的。zui重要的是要誠(chéng)實(shí),一旦我們意識(shí)到,就要糾正錯(cuò)誤。”

    對(duì)于miRNA的分離,很多實(shí)驗(yàn)室都是使用TRIzol試劑。但從這篇文章的結(jié)論來(lái)看,TRIzol很可能會(huì)影響部分實(shí)驗(yàn)結(jié)果。吸取Narry Kim的教訓(xùn),大家還是采用兩種分離方法,來(lái)驗(yàn)證結(jié)果的可靠性。同時(shí),希望Life Tech的研發(fā)部門好好研究一下,發(fā)布更為可靠的操作步驟。

 

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