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溫州醫(yī)科大學(xué)Cell子刊發(fā)表測(cè)序新發(fā)現(xiàn)

時(shí)間:2016-6-20閱讀:247
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來(lái)自溫州醫(yī)科大學(xué)、北京大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院的研究人員通過(guò)測(cè)序在少牙畸形(Oligodontia)個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了一些WNT10B突變。這項(xiàng)研究發(fā)布在6月16日的Cell子刊《AJHG》雜志上。

溫州醫(yī)科大學(xué)的蔡濤(Tao Cai)教授和北京大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院的馮海蘭(Hailan Feng)教授是這篇文章的共同通訊作者。

先天性缺牙是人類zui常見(jiàn)的發(fā)育異常性疾病之一。其發(fā)病率為1.6%~20%不等,它可以單獨(dú)發(fā)生,也可以和綜合征型伴發(fā)。其中少牙畸形(oligodontia)是一種嚴(yán)重的先天性缺牙亞型,表現(xiàn)為非綜合征型,缺牙數(shù)目在6顆以上, 有文獻(xiàn)報(bào)道少牙畸形的發(fā)病率約為0.08%~1.1%。而缺牙數(shù)目少于6顆時(shí)通常被稱之為牙齒發(fā)育不全(hypodontia)。

先天性缺牙的發(fā)病原因包括兩個(gè)方面:有類似如放射、化療大劑量用藥的環(huán)境因素影響,同時(shí)基因的突變與疾病的發(fā)生密切相關(guān)。大部分的病例認(rèn)為先天性缺牙與遺傳因素有關(guān)。近年隨著分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的不斷進(jìn)步,對(duì)人類遺傳性疾病的研究更加深入。牙齒缺失影響患者的咀嚼、發(fā)音功能和顏面美觀,對(duì)患者身心健康造成巨大影響,先天性缺牙在中國(guó)人中的發(fā)病率較高,但是相關(guān)的遺傳學(xué)研究進(jìn)展較少。

在當(dāng)前的研究中,研究人員通過(guò)全外顯子組測(cè)序在少牙畸形中國(guó)家族中鑒別了致病突變。他們?cè)谒惺芾奂彝コ蓡T中檢測(cè)到了一種WNT10B雜合錯(cuò)義突變(c.632G>A [p.Arg211Gln])。通過(guò)采用Sanger測(cè)序方法測(cè)序145位罹患非綜合征型少牙畸形的無(wú)關(guān)個(gè)體,他們確定了另外3個(gè)突變:c.569C>G [p.Pro190Arg]、c.786G>A [p.Trp262∗]和 c.851T>G [p.Phe284Cys]。

有意思地是,分析基因型-表型相關(guān)性揭示出WNT10B突變影響了恒牙,尤其是側(cè)切牙的發(fā)育。此外,功能分析證實(shí)在HEPG2上皮細(xì)胞中每個(gè)突變都無(wú)法正常增強(qiáng)經(jīng)典Wnt信號(hào)。值得注意地是,這些突變WNT10B配體無(wú)法有效誘導(dǎo)牙髓干細(xì)胞內(nèi)皮分化。

這些研究結(jié)果確定了少牙畸形個(gè)體中一些常染色體顯性WNT10B突變,增大了先天性牙發(fā)育不全的范圍,揭示出了在牙髓干細(xì)胞內(nèi)皮分化中減弱的Wnt信號(hào)。

外顯子組測(cè)序是指利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測(cè)序的基因組分析方法。由于外顯子組測(cè)序只需針對(duì)外顯子區(qū)域的DNA即可(例如:人類外顯子組只占人類基因組長(zhǎng)度的約1%,但是目前由DNA變異引起的疾病估計(jì)有85%以上來(lái)自于外顯子組區(qū)域的變異),因此遠(yuǎn)比進(jìn)行全基因組序列測(cè)序更簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì)、,其目標(biāo)區(qū)域覆蓋度也更高,便于變異檢測(cè)。

來(lái)自電子科技大學(xué)、中科院和新加坡國(guó)家眼科中心等機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)中國(guó)漢族組群進(jìn)行外顯子組測(cè)序發(fā)現(xiàn),F(xiàn)GD6基因中的一個(gè)錯(cuò)義變異提高了息肉狀脈絡(luò)膜血管病變(polypoidal choroidal vasculopathy,PCV)的風(fēng)險(xiǎn)。這一研究發(fā)現(xiàn)發(fā)布在2016年4月18日的Nature Genetics雜志上

來(lái)自中山大學(xué)、美國(guó)國(guó)家心理衛(wèi)生研究院、約翰霍普金斯大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員,通過(guò)對(duì)腫瘤-正常組織樣本進(jìn)行全基因組和全外顯子組測(cè)序,描繪出了食管鱗狀細(xì)胞癌的基因組特征,揭示出了一些導(dǎo)致腫瘤發(fā)生和不良預(yù)后的關(guān)鍵基因。這一研究成果于2016年4月發(fā)布在Cell子刊《AJHG》雜志上(中山大學(xué)Cell子刊發(fā)表癌癥研究新成果)。

來(lái)自上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院的研究人員報(bào)告稱,她們采用全外顯子及靶向測(cè)序技術(shù)鑒別出了ROBO1和ROBO2突變是與骨髓增生異常綜合征(Myelodysplastic Syndrome MDS)疾病進(jìn)展相關(guān)的驅(qū)動(dòng)子。這一研究成果發(fā)布在2015年11月26日的Nature Communications雜志上。(子科生物(田清清)報(bào)道)

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