來自中科院昆明動(dòng)物研究所、中科院北京生命科學(xué)研究院和蘭州大學(xué)的研究人員，在新研究中揭示出了高海拔哺乳動(dòng)物瘤胃微生物組的趨同進(jìn)化。研究結(jié)果發(fā)布在6月16日的《Current Biology》雜志上。

中科院昆明動(dòng)物研究所的施鵬（Peng Shi）研究員、中科院北京生命科學(xué)研究院趙方慶（Fangqing Zhao）研究員和蘭州大學(xué)的龍瑞軍（Ruijun Long）教授教授是這篇論文的共同通訊作者。

研究遺傳適應(yīng)是進(jìn)化生物學(xué)的一個(gè)中心焦點(diǎn)，一直以來大多數(shù)的這類研究通常都將焦點(diǎn)放在宿主的基因組上，而很少涉及共同進(jìn)化的微生物組。青藏高原（QTP）為人類和其他哺乳動(dòng)物物種提供了一個(gè)zui的生存環(huán)境。牦牛（Yaks）和藏系綿羊已適應(yīng)了在這一嚴(yán)酷的高原環(huán)境中生活，游牧藏民飼養(yǎng)這些動(dòng)物以獲取食物及維持生計(jì)。

在這篇文章中，研究人員揭示出了在兩種高原反芻動(dòng)物牦牛和藏系綿羊中為持續(xù)地獲得能量瘤胃微生物組發(fā)生的趨同進(jìn)化。相比于低海拔的近親家牛（cattle）和普通綿羊，兩種反芻動(dòng)物生成了顯著低水平的甲烷及高水平的揮發(fā)性脂肪酸(VFAs)。超深度宏基因組測(cè)序揭示出在高海拔反芻動(dòng)物中富含生成VFA的瘤胃微生物基因信號(hào)通路，而在家牛宏基因組中富含甲烷生成信號(hào)通路。分析RNA轉(zhuǎn)錄組揭示，在高海拔反芻動(dòng)物瘤胃上皮中與VFA運(yùn)輸和吸收相關(guān)的36個(gè)基因顯著上調(diào)。這些研究結(jié)果重新認(rèn)識(shí)了微生物組對(duì)哺乳動(dòng)物適應(yīng)性進(jìn)化的貢獻(xiàn)。

牦牛是我國西部高寒高海拔地區(qū) *的家畜,主要分布在我國青藏高原海拔3000米以上的地區(qū)。牦牛經(jīng)過長(zhǎng)時(shí)間的自然選擇,能夠適應(yīng)高海拔地區(qū)寒冷和低氧的自然環(huán)境,是研究環(huán)境適應(yīng)性的模式物種之一。2012年來自蘭州大學(xué)，深圳華大基因研究院，昆明動(dòng)物研究所以及美韓等處的研究人員完成了已馴化牦?；蚪M的測(cè)序圖譜工作，并進(jìn)行了初步分析，從中揭示了關(guān)于高海拔動(dòng)物的相關(guān)遺傳適應(yīng)性。研究成果發(fā)布在Nature Genetics雜志上（中國學(xué)者基因組研究登Nature Genetics ）。

RNA-Seq 作為近年來新發(fā)展起來的高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù), 為大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究提供了一種全新的且更為有效的方法，2014年來自西南民族大學(xué)，深圳華大基因的研究人員以牦牛卵巢組織作為研究對(duì)象, 應(yīng)用RNA-Seq技術(shù)對(duì)其進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,獲得了卵巢測(cè)序文庫，并進(jìn)行了深入分析。這為描繪牦牛卵巢正常轉(zhuǎn)錄組圖譜及進(jìn)一步探析牦牛繁殖性能提供了基礎(chǔ)

2015年，來自蘭州大學(xué)、四川大學(xué)的研究人員通過對(duì)牦牛進(jìn)行全基因組重測(cè)序揭示出了一些馴化標(biāo)簽和的種群擴(kuò)張。這項(xiàng)研究發(fā)布在Nature Communications雜志上。（子科生物編輯：田清清）