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西安交大一附院李磊教授用單細(xì)胞外顯子組測(cè)序研究腎細(xì)胞癌

時(shí)間:2016-12-22閱讀:1339
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深圳子科生物報(bào)道:腎細(xì)胞癌(RCC)占成人惡性腫瘤的3%,和腎腫瘤的90%~95%。轉(zhuǎn)移性疾病通常會(huì)對(duì)放療和化療產(chǎn)生耐藥性。免疫治療表現(xiàn)出15%至20%的有限反應(yīng)率。腫瘤干細(xì)胞(CSCs)是腎癌發(fā)生、發(fā)展以及耐藥性的關(guān)鍵參與因子。以前的研究已經(jīng)表明,RCC是一種遺傳學(xué)明顯不同的成人癌癥,具有相對(duì)較低的突變率。測(cè)序分析表明,一些常見(jiàn)的體細(xì)胞突變?cè)赗CC患者之間是共有的。zui近,單細(xì)胞外顯子組測(cè)序已被用于評(píng)估許多類(lèi)型腫瘤中的體細(xì)胞突變。然而,尚未系統(tǒng)地將該技術(shù)用于識(shí)別RCC的CSCs中的關(guān)鍵基因。

zui近,來(lái)自西安交通大學(xué)*附屬醫(yī)院、中科院生物物理研究所、北京Jianlan醫(yī)學(xué)研究所、深圳羅湖醫(yī)院、中科院微生物研究所和諾禾致源生物信息科技有限公司的研究人員,利用單細(xì)胞外顯子組測(cè)序,將KCP、LOC440040和LOC440563突變確定為腎細(xì)胞癌干細(xì)胞中的驅(qū)動(dòng)因子。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在12月16日的《Cell Research》雜志。這篇論文的通訊作者是西安交通大學(xué)*附屬醫(yī)院泌尿外科教授李磊博士。

在這項(xiàng)研究中,研究人員利用單細(xì)胞外顯子組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)CD133+ RCC細(xì)胞有CSC特性,并可能來(lái)源于癌細(xì)胞,而不是正常腎細(xì)胞。KCP、LOC440040和LOC440563突變是新的腎腫瘤干細(xì)胞驅(qū)動(dòng)基因。LOC440563編碼一個(gè)RNA結(jié)合蛋白,其屬于不均一核糖核蛋白(hnRNPs)。它影響前mRNA的加工、代謝和運(yùn)輸。LOC440563在結(jié)腸癌中是顯著突變的;然而,這些基因突變不同于我們?cè)赗CC腫瘤干細(xì)胞中所確定的。考慮到hnRNP家族對(duì)DNA損傷修復(fù)的貢獻(xiàn),很可能LOC440563突變通過(guò)損害DNA修復(fù)過(guò)程而驅(qū)動(dòng)CSC的多能性。

LOC440040是一個(gè)GRM5(谷氨酸受體、代謝型5)假基因。GRM5屬于mGluR家族,失調(diào)的谷氨酸信號(hào)參與了許多類(lèi)型的癌癥,如神經(jīng)膠質(zhì)瘤、黑色素瘤。然而,LOC440040和癌癥之間的關(guān)系目前還不清楚。確定突變體LOC440040是否影響RCC CSC群的谷氨酸能信號(hào),將是十分必要的。

KCP編碼一個(gè)分泌蛋白,它在TGF-β途徑的調(diào)控作用中發(fā)揮復(fù)雜的作用。異常的KCP水平可能導(dǎo)致無(wú)數(shù)的腎臟病理與癌癥。這項(xiàng)工作中所確定的KCP突變是否通過(guò)影響TGF-β信號(hào)而促進(jìn)腫瘤干細(xì)胞的自我更新?十分有必要弄清這些問(wèn)題。zui后,這項(xiàng)研究表明,KCP、LOC440040、LOC440563突變——目前存在于至少20%的參與調(diào)查的患者中,構(gòu)成了強(qiáng)大而危險(xiǎn)的驅(qū)動(dòng)因子,促進(jìn)腎細(xì)胞癌癌細(xì)胞重編程為CSCs。因此,它們可以作為RCC重要的預(yù)后因素和治療靶點(diǎn)。

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