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上海莼試生物技術有限公司

捻轉毛細線蟲PCR試劑盒常見問題的常見原因

時間:2020-4-2閱讀:461
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捻轉毛細線蟲PCR試劑盒常見問題的常見原因

1. cDNA產量的很低可能的原因:

1) RNA模板質量低

2) 對mRNA濃度估計過高

3)反應體系中存在反轉錄酶抑制劑或反轉錄酶量不足

4)同位素磷32過期

5)反應體積過大,不應超過50μl

2. 擴增產物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺

1)zui常見的原因在于您的反應體系是PCR的反應體系而不是RT-PCR的反應體系

3) 與反應起始時RNA的總量及純度有關

4) 建議在試驗中加入對照RNA

5) 第yi鏈的反應產物在進行PCR擴增時,在總的反應體系中的含量不要超過1/10

6) 建議用Oligo(dT)或隨機引物代替基因特異性引物(GSP)用于第yi鏈合成。由于RNA模板存在二級結構,如環(huán)狀結果,有可能導致GSP無法與模板退火;或SSⅡ反轉錄酶無法從此引物進行有效延伸。

7) 目的mRNA中含有強的轉錄中止位點,可以試用以下方法解決:

a. 將第yi鏈的反應溫度提高至50℃。

b. 使用隨機六聚體代替Oligo(dT)進行第yi鏈反應。

3. 產生彌散(smear)條帶

1)在PCR反應體系中第yi鏈產物的含量過高

2)減少引物的用量

3)優(yōu)化PCR反應條件/減少PCR的循環(huán)次數(shù)

4)在用DNase處理被DNA污染的RNA樣品時,其產生的寡核苷酸片段會產生非特異性擴增,一般會顯示為彌散背景。

4. 產生非特異性條帶

1)用RT陰性對照檢測是否被基因組DNA污染。如果RT陰性對照的PCR結果也顯示同樣條帶,則需要用DNase I重新處理樣品。

2)在PCR反應中,非特異的起始擴增將導致產生非特異性結果。在低于引物Tm 2至5℃的溫度下進行退火,降低鎂離子或是目的DNA的量將減少非特異性結果的產生。

3)由于mRNA剪切方式的不同,根據選擇引物的不同將導致產生不同的RT-PCR結果。

5. 產生大分子量的彌散條帶

1)大多數(shù)情況下是由于退火溫度過低而導致的非特異性的起始及延伸產生的

2)對于長片段的PCR,建議將反應體系中cDNA的濃度稀釋至1:10(或1:100-1:200)

6. 在無反轉錄酶的情況下,對照RNA獲得擴增結果詳細解析關于Elisa試劑盒的儲存于有效期多久

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