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禽流感熒光定量PCR檢測試劑盒反應五要素技術

2021-2-4  閱讀(178)

禽流感熒光定量PCR檢測試劑盒技術參數(shù):

1. 符合行業(yè)標準SN/T 1686-2005《新城疫病毒中強毒株檢測方法:熒光RT-PCR法》的檢測要求,可用于禽肉、禽類組織臟器、禽類排泄和分泌物,及其泄殖腔和咽喉拭樣中新城疫病毒的檢測。

2. 靈敏度:對于接種的雞胚尿囊液,檢測的zui高稀釋度可達10-8~10-7,與雞胚病毒分離方法的靈敏度接近。定量檢測線性范圍可達10-1010拷貝/ml。

3. 特異性:采用基因序列數(shù)據(jù)庫設計,并通過系統(tǒng)驗證,新城疫病毒RT-PCR能夠檢測所有已知新城疫病毒毒株。對于其它禽類感染因子,本試劑盒檢測結(jié)果為陰性。

4. 產(chǎn)品盒組成:(不包括新城疫病毒RNA提取試劑,用戶可采用通用型病毒RNA提取試劑盒或試劑盒的提取方法。) 組成成份(48T/kit) 規(guī)格 數(shù)量 RNA提取液 30ml 1瓶 DEPC水 5 ml 1瓶 新城疫病毒RT-PCR一步法反應液 920ul 1管 逆轉(zhuǎn)錄酶(5U/ul) 48ul 1管 Taq HS酶(5U/ul) 24ul 1管 新城疫病毒陽性對照 100ul 1管 新城疫病毒陰性對照 100ul 1管 使用說明書 一份。

禽流感熒光定量PCR檢測試劑盒反應五要素:

①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。

②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。

③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構,避免兩條引物間互補,特別是3’端的互補,否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴增條帶。

⑤引物3’端的堿基,特別是zui末及倒數(shù)第二個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。

⑥引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴增的靶序列zui有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處。

⑦引物的特異性:引物應與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。



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