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上海雅吉生物科技有限公司

主營產(chǎn)品: 培養(yǎng)原代細胞,細胞系價格,耐藥細胞株,實時熒光pcr試劑盒

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沿岸單孢子蟲PCR試劑盒說明書

2019-8-9  閱讀(230)

沿岸單孢子蟲PCR試劑盒

 

中英文名稱

規(guī)格

價格

說明書

Haplosporidium costale

沿岸單孢子蟲PCR試劑盒

50

1490

 

運輸:低溫

保存:負20

有效期:一年

貨期:2-3

產(chǎn)品及特點

1. 即開即用,用戶只需要提供沿岸單孢子蟲樣品。

2. 根據(jù)沿岸單孢子蟲保守序列設計的專一性引物,與相關病毒無交叉反應。

3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應。

4. 一管式熒光定量PCR檢測,避免后續(xù)污染。

5. 本試劑盒足夠50次20μL反應體系的熒光定量PCR。

本產(chǎn)品只適用于科研,不能用于臨床診斷。

規(guī)格及成分

成分

編號

十孔盒包裝

2×qPCR MagicMix

試劑一

500μL(棕色管)

熒光PCR模板稀釋液

試劑二

1 mL(黃蓋)

沿岸單孢子蟲PCR引物混合物

試劑三

100μL(白蓋)

沿岸單孢子蟲PCR陽性對照

(1×10E8 拷貝/μL)

試劑四

50μL(紅蓋)

使用手冊

試劑五

1

運輸及保存

低溫運輸,-20℃保存,保存期限一年。

自備試劑 

DNA模板、10×ROX(根據(jù)機型決定,具體見使用方法)。

使用方法

、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)

1. 注意:由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的DNA片段作為陽性對照。

2. 標記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。

3. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。

4. 在7號管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

5. 換槍頭,在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

6. 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中,充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

7. 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。

二、樣品DNA的制備

8. 如果有N個樣品,必須設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL上步制備的PCR陽性對照的第4號(濃度為1×10E4 拷貝/μL,10μL相當于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5 拷貝/μL,10μL相當于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,則PC和NC的體積也必須是200μL。

9. 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。

三、設置qPCR反應(20 μL體系,在樣品制備室進行)

10. 如果只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用于PCR陽性對照。如果做2-3次重復,則反應設置數(shù)量相應增加2或3倍。

11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):

成分

樣品管

N+2

PCR陰性對照管

PCR陽性

對照管(2-7管)

2×qPCR MagicMix

(棕色管)

10 μL

10 μL

各10 μL

沿岸單孢子蟲PCR

引物混合液(白蓋)

2 μL

2 μL

各2 μL

自備10×ROX (見注)

2 μL

2 μL

各2 μL

 N+2待測樣品DNA模板

6 μL

不加

不加

第7步所得PCR陽性對照

稀釋液(2-7號)

不加

不加

各6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管…)

注:僅ABI7500、7700和7900儀器需要使用ROX作為對照,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,則用水替代。

12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化)。

過程

溫度

時間

預變性

92℃

5分鐘

PCR反應

(30個循環(huán))

92℃

60 

54℃

60 

72℃

60 

13. 數(shù)據(jù)采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結合DNA時,大吸收光譜在471 nm,結合DNA時的大吸收光譜在500 nm,大發(fā)射光譜在530 nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。

四、數(shù)據(jù)處理

14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。

如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。



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