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細(xì)胞“自噬”的新秘鑰:看“棕櫚?;比绾谓怄i自噬體形成的奧秘

2025-3-21  閱讀(155)

  研究背景
 
  自噬是細(xì)胞內(nèi)一種通過(guò)雙層膜結(jié)構(gòu)的自噬體包裹并降解細(xì)胞質(zhì)成分(如錯(cuò)誤折疊蛋白、損傷細(xì)胞器和入侵微生物)的降解途徑,對(duì)維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、細(xì)胞發(fā)育、免疫反應(yīng)和細(xì)胞死亡至關(guān)重要,其失調(diào)與癌癥、糖尿病和神經(jīng)退行性疾病相關(guān)。自噬體的形成由ATG蛋白調(diào)控,其中ATG16L1是關(guān)鍵蛋白,它與ATG12-ATG5結(jié)合形成復(fù)合物,催化LC3脂化,促進(jìn)自噬體形成,并參與細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌隔離、線粒體自噬及炎癥調(diào)節(jié)。S-棕櫚?;?/strong>是一種可逆的翻譯后修飾,通過(guò)在半胱an酸殘基上添加棕櫚?;鶊F(tuán),影響蛋白質(zhì)相互作用和膜結(jié)合,調(diào)節(jié)細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)和蛋白功能。
 
  本篇文獻(xiàn)“ZDHHC 7介導(dǎo)的ATG 16 L1S-棕櫚?;龠M(jìn)LC 3脂化和自噬體形成”,主要為了探索ATG16L1的S-棕櫚?;稽c(diǎn)及其對(duì)LC3脂化和自噬體形成的影響,以期闡明自噬調(diào)控機(jī)制。
 
  研究?jī)?nèi)容
 
  1. ATG16L1發(fā)生S-棕櫚?;?br /> 
  首先,通過(guò)?;飐u交換(ABE)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)ATG16L1的S-棕櫚酰化狀態(tài),發(fā)現(xiàn)HEK293T細(xì)胞中的內(nèi)源性ATG16L1以及MCF7細(xì)胞中過(guò)表達(dá)的ATG16L1均顯示出明顯的生物su信號(hào),表明ATG16L1是一個(gè)S-棕櫚?;鞍?/strong>。此外,使用棕櫚酰化抑制劑2-溴棕櫚酸(2-BP)處理細(xì)胞可顯著降低ATG16L1的修飾水平,進(jìn)一步證實(shí)了其S-棕櫚?;癄顟B(tài)。實(shí)驗(yàn)還發(fā)現(xiàn),自噬誘導(dǎo)(EBSS和Torin 1)可顯著增加ATG16L1的S-棕櫚?;?,而自噬抑制(VPS34-IN1)則降低其S-棕櫚?;?,表明ATG16L1的S-棕櫚酰化響應(yīng)自噬信號(hào)。
 
  2. ATG16L1S-棕櫚?;稽c(diǎn)
 
  為了確定ATG16L1的S-棕櫚?;稽c(diǎn),研究者構(gòu)建了多個(gè)截短突變體和位點(diǎn)突變體。通過(guò)ABE實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)ATG16L1的Cys153是主要的S-棕櫚?;稽c(diǎn)。突變?cè)撐稽c(diǎn)(C153S)后,ATG16L1的S-棕櫚?;斤@著降低,表明Cys153是關(guān)鍵的修飾位點(diǎn)。
 
3. ATG16L1的S-棕櫚?;瘜?duì)LC3脂化的影響
 
  作者利用ATG16L1基因敲除(KO)HeLa細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)ATG16L1的缺失導(dǎo)致LC3-II的缺失,而重新表達(dá)野生型ATG16L1可恢復(fù)LC3-II的生成。然而,表達(dá)S-棕櫚?;毕莸腁TG16L1-C153S突變體則無(wú)法恢復(fù)LC3-II的生成。在自噬誘導(dǎo)(EBSS或Baf-A1)條件下,野生型ATG16L1可顯著促進(jìn)LC3-II的生成,而ATG16L1-C153S突變體則無(wú)法響應(yīng)自噬誘導(dǎo),表明ATG16L1S-棕櫚?;瘜?duì)LC3脂化過(guò)程至關(guān)重要。
 
  4. ATG16L1S-棕櫚?;瘜?duì)自噬體形成的影響
 
  通過(guò)在ATG16L1-KO HeLa細(xì)胞中穩(wěn)定表達(dá)EGFP-LC3,并重新表達(dá)野生型ATG16L1或ATG16L1-C153S突變體,研究者發(fā)現(xiàn)野生型ATG16L1可顯著增加EGFP-LC3點(diǎn)狀結(jié)構(gòu)(自噬體標(biāo)記)的數(shù)量,而ATG16L1-C153S突變體則無(wú)法恢復(fù)自噬體的形成。進(jìn)一步通過(guò)GFP-RFP-LC3雙熒光實(shí)驗(yàn)和透射電子顯微鏡(TEM)觀察發(fā)現(xiàn),野生型ATG16L1可促進(jìn)自噬體和自噬溶酶體的形成,而ATG16L1-C153S突變體則無(wú)法促進(jìn)這些結(jié)構(gòu)的形成。此外,實(shí)驗(yàn)還表明ATG16L1的S-棕櫚?;毕莶挥绊懲淌审w的形成,但會(huì)抑制自噬體的成熟。
 
5. ZDHHC7介導(dǎo)ATG16L1的S-棕櫚?;?br /> 
  接著,通過(guò)共免疫沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),ZDHHC7與ATG16L1相互作用,并且這種相互作用在自噬誘導(dǎo)條件下增強(qiáng)。進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)表明,ZDHHC7過(guò)表達(dá)可顯著增加ATG16L1的S-棕櫚?;?,而ZDHHC7的催化活性位點(diǎn)突變體(ZDHHC7-C160S)則無(wú)法促進(jìn)ATG16L1的S-棕櫚?;?。在ZDHHC7基因敲除(KO)細(xì)胞中,ATG16L1的S-棕櫚?;斤@著降低,而重新表達(dá)ZDHHC7可恢復(fù)ATG16L1的S-棕櫚?;?,表明ZDHHC7ATG16L1 S-棕櫚酰化的關(guān)鍵酶。
 
6. ZDHHC7介導(dǎo)的ATG16L1 S-棕櫚?;瘜?duì)自噬的影響
 
  在ZDHHC7-KO細(xì)胞中,LC3-II的生成和自噬體的形成受到抑制,而重新表達(dá)ZDHHC7可恢復(fù)這些過(guò)程,而ZDHHC7-C160S突變體則無(wú)法恢復(fù)。此外,ZDHHC7過(guò)表達(dá)可促進(jìn)LC3-II的生成和自噬體的形成,而ZDHHC7-KO則抑制這些過(guò)程。這些結(jié)果表明ZDHHC7介導(dǎo)的ATG16L1 S-棕櫚?;贚C3脂化和自噬體形成中發(fā)揮重要作用。
 
7. ATG16L1的S-棕櫚?;瘜?duì)其相互作用的影響
 
  研究者發(fā)現(xiàn),ATG16L1的S-棕櫚?;瘜?duì)其與WIPI2B和RAB33B(WIPI2B通過(guò)招募ATG16L1復(fù)合物促進(jìn)LC3脂化,而RAB33B則通過(guò)運(yùn)輸ATG16L1復(fù)合物確保其在吞噬體上的定位)的相互作用具有顯著影響。野生型ATG16L1與WIPI2B和RAB33B的相互作用強(qiáng)于S-棕櫚?;毕莸腁TG16L1-C153S突變體。此外,ZDHHC7過(guò)表達(dá)可增強(qiáng)ATG16L1與WIPI2B和RAB33B的相互作用,而2-BP處理則削弱這種相互作用。這些結(jié)果表明,ATG16L1S-棕櫚?;ㄟ^(guò)增強(qiáng)其與WIPI2BRAB33B的相互作用,促進(jìn)ATG16L1復(fù)合物在吞噬體上的募集,從而促進(jìn)LC3脂化和自噬體的形成。
 
研究結(jié)論
 
  本研究揭示了ZDHHC7介導(dǎo)的ATG16L1 S-棕櫚?;ㄟ^(guò)增強(qiáng)其與WIPI2B和RAB33B的相互作用,促進(jìn)LC3脂化和自噬體的形成,從而為自噬的調(diào)控提供了新的分子機(jī)制。
 
  Wei F, Wang Y, Yao J, Mei L, Huang X, Kong H, Chen J, Chen X, Liu L, Wang Z, Wang J, Song J, Kong E, Yang A. ZDHHC7-mediated S-palmitoylation of ATG16L1 facilitates LC3 lipidation and autophagosome formation. Autophagy. 2024 Dec;20(12):2719-2737. doi: 10.1080/15548627.2024.2386915. Epub 2024 Aug 11. PMID: 39087410; PMCID: PMC11587844.
 


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