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新型強(qiáng)效銅離子載體通過(guò)共價(jià)靶向PRDX1誘導(dǎo)銅死亡用于三陰性乳腺癌治療

2025-5-7  閱讀(65)

  各位讀者好,今天為大家?guī)?lái)一篇使用整合轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)和分子對(duì)接策略來(lái)研究pochonin D(PoD)在三陰性乳腺癌(TNBC)中的作用、潛在靶點(diǎn)和機(jī)制的高分文章,是由中國(guó)藥科大學(xué)團(tuán)隊(duì)2025年2月在ACS Cent Sci發(fā)表的,題為“Discovery of Natural Resorcylic Acid Lactones as Novel Potent Copper Ionophores Covalently Targeting PRDX1 to Induce Cuproptosis for Triple-Negative Breast Cancer Therapy”。從中藥內(nèi)生真菌中分離出天然產(chǎn)物,誘導(dǎo)三陰性乳腺癌(TNBC)細(xì)胞發(fā)生銅死亡,為T(mén)NBC的治療提供了新的理論依據(jù),也為T(mén)NBC的臨床治療藥物提供了可能。
 
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  三陰性乳腺癌(TNBC)是一種侵襲性強(qiáng)的乳腺癌亞型,缺乏雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)和人表皮生長(zhǎng)因子受體2(HER2)表達(dá),導(dǎo)致分子靶向療法通常無(wú)效,患者預(yù)后差,急需新的治療靶點(diǎn)和有效藥物。銅死亡是2022年新發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞死亡形式,由銅與三羧酸循環(huán)的脂?;煞种苯咏Y(jié)合觸發(fā),在癌癥治療中具有潛在應(yīng)用價(jià)值。銅離子載體在銅死亡的發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用中發(fā)揮了重要作用,可能成為抗腫瘤藥物。天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)多樣、生物活性高、毒性低,約50%的抗癌藥物直接或間接來(lái)源于天然產(chǎn)物。間苯二酸內(nèi)酯(RALs)是一類(lèi)真菌來(lái)源的聚酮化合物,具有多種生物活性,可能成為治療TNBC的潛在藥物。
 
  本研究從植物內(nèi)生真菌llyonectria sp.中分離出24個(gè)間苯二酸內(nèi)酯(RALs),其中9個(gè)為新化合物。研究發(fā)現(xiàn)Pochonin D(PoD)能有效抑制三陰性乳腺癌(TNBC)細(xì)胞增殖。通過(guò)多種技術(shù)確定PRDX1是PoD的直接靶點(diǎn),PoD通過(guò)與PRDX1的Cys173位點(diǎn)共價(jià)結(jié)合,抑制其酶活性,誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)銅積累,觸發(fā)銅死亡,發(fā)揮抗TNBC活性。此外,PRDX1高表達(dá)與TNBC患者預(yù)后不良相關(guān),PRDX1抑制劑可能是潛在的銅離子載體,為T(mén)NBC治療提供了新策略。
 
  研究框架:
 
  1. 提出問(wèn)題
 
  TNBC是侵襲性強(qiáng)的乳腺癌亞型,缺乏有效治療靶點(diǎn),而銅死亡是新型細(xì)胞死亡形式,因此識(shí)別誘導(dǎo)TNBC銅死亡的藥物靶點(diǎn)和銅離子載體是臨床急需解決的問(wèn)題。
 
  2. 研究框架
 
  從植物內(nèi)生真菌中分離化合物,評(píng)估其對(duì)TNBC細(xì)胞的活性,確定有效化合物,再深入研究其作用機(jī)制和靶點(diǎn)。
 
  3. 研究方法
 
  化合物分離鑒定:采用代謝組學(xué)和抗腫瘤活性導(dǎo)向分離法,從內(nèi)生真菌中分離24個(gè)間苯二酸內(nèi)酯(RALs),用多種光譜技術(shù)確定結(jié)構(gòu)。
 
  活性評(píng)估:用細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)、克隆形成實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞周期和凋亡實(shí)驗(yàn)等評(píng)估化合物活性。
 
  機(jī)制研究:用轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)分析、CMap、OTTER等技術(shù),結(jié)合臨床樣本,研究化合物作用機(jī)制和靶點(diǎn)。
 
  4. 分析數(shù)據(jù)
 
  對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,如比較不同處理組細(xì)胞活性、基因表達(dá)差異等,確定化合物活性和作用機(jī)制。
 
  5. 得出結(jié)論
 
  發(fā)現(xiàn)Pochonin D(PoD)能有效抑制TNBC細(xì)胞增殖,通過(guò)結(jié)合PRDX1抑制其酶活性,干預(yù)銅死亡發(fā)揮抗癌作用,表明PRDX1是與銅死亡相關(guān)的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),PoD是新型銅離子載體。
 
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研究流程示意圖
 
  結(jié)果解析:
 
  1. RALs的分離與結(jié)構(gòu)鑒定
 
  從植物內(nèi)生真菌Ilyonectria sp. FL - 710中分離出24個(gè)RALs,包括9個(gè)新化合物。通過(guò)多種光譜分析、NMR和ECD計(jì)算以及X射線晶體學(xué)確定了它們的結(jié)構(gòu)和構(gòu)型。如ilyolactone A,根據(jù)HRESIMS、NMR等數(shù)據(jù)確定其分子式為C19H23ClO8,并通過(guò)X射線衍射確定其絕對(duì)構(gòu)型。
 
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2. Pochonin D(PoD)對(duì)TNBC細(xì)胞的抑制作用
 
  體外實(shí)驗(yàn):PoD對(duì)六種人類(lèi)癌細(xì)胞系有顯著細(xì)胞毒性,對(duì)TNBC細(xì)胞系有劑量和時(shí)間依賴性抑制活性,對(duì)正常乳腺細(xì)胞MCF-10A毒性較低。結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系研究表明,α,β-不飽和酮基、C-4-C-5的環(huán)氧結(jié)構(gòu)和雙鍵、C-13的氯原子等對(duì)活性有重要影響。PoD可劑量依賴性降低MDA-MB-231和4T1細(xì)胞的克隆形成能力,使細(xì)胞周期阻滯在G2/M期,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。
 
  體內(nèi)實(shí)驗(yàn):建立TNBC異種移植小鼠模型,PoD劑量依賴性抑制腫瘤生長(zhǎng),降低腫瘤重量和體積,且在有效劑量下無(wú)明顯毒性。
 
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3. PoD觸發(fā)TNBC細(xì)胞銅死亡
 
  通過(guò)RNA測(cè)序和CMap數(shù)據(jù)庫(kù)分析,發(fā)現(xiàn)PoD與已知銅死亡誘導(dǎo)劑雙硫侖正相關(guān),能顯著影響銅死亡相關(guān)調(diào)控基因。
 
  細(xì)胞銅比色測(cè)定和熒光顯微鏡成像顯示PoD增加細(xì)胞內(nèi)銅含量,銅增強(qiáng)PoD對(duì)TNBC細(xì)胞的細(xì)胞毒性,銅螯合劑TM可減弱其毒性。
 
  分光光度滴定和化學(xué)位移變化表明PoD與銅結(jié)合。
 
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4. PRDX1是PoD的直接靶點(diǎn)且在TNBC中高表達(dá)
 
  利用生物su標(biāo)記的PoD探針和質(zhì)譜分析,確定PRDX1是PoD的潛在靶點(diǎn)。OTTER分析也富集到PRDX1及相關(guān)相互作用蛋白。
 
  TCGA數(shù)據(jù)和免疫組織化學(xué)分析顯示PRDX1在乳腺癌中高表達(dá),且高表達(dá)與患者預(yù)后不良和生存期短相關(guān)。
 
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5. PoD與PRDX1的結(jié)合特性
 
  微尺度熱泳(MST)、等溫滴定量熱法(ITC)、細(xì)胞熱位移分析(CETSA)和藥物親和力響應(yīng)性靶點(diǎn)穩(wěn)定性(DARTS)實(shí)驗(yàn)表明PoD與PRDX1有高親和力結(jié)合,抑制PRDX1的酶活性,誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)活性氧(ROS)積累。
 
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6. PoD與PRDX1的共價(jià)結(jié)合位點(diǎn)
 
  對(duì)比PoD和缺乏α,β - 不飽和酮基的衍生物,表明PoD的細(xì)胞毒性依賴于該基團(tuán)。
 
  對(duì)接模擬和MST、CETSA、DARTS及下拉實(shí)驗(yàn)確定PoD通過(guò)α,β - 不飽和酮基與PRDX1的Cys173共價(jià)結(jié)合。
 
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7. PRDX1在TNBC中的生理功能及PoD的抗癌機(jī)制
 
  構(gòu)建PRDX1敲低(PRDX1 - KD)和過(guò)表達(dá)(PRDX1 - OV)的TNBC細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)PRDX1表達(dá)影響細(xì)胞增殖,PoD對(duì)細(xì)胞增殖的抑制作用依賴于PRDX1表達(dá)水平。
 
  PRDX1 - KD細(xì)胞中ROS和銅離子水平升高,PoD誘導(dǎo)的銅離子升高在PRDX1 - KD細(xì)胞中減弱。其他PRDX1抑制劑也能誘導(dǎo)不同程度的銅離子積累。
 
  小鼠模型實(shí)驗(yàn)表明PRDX1影響體內(nèi)腫瘤生長(zhǎng),PoD對(duì)TNBC細(xì)胞的抗癌作用依賴于PRDX1。
 
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研究結(jié)論:
 
  本文從植物內(nèi)生真菌中分離出24種間苯二酸內(nèi)酯(RALs),其中9種為新發(fā)現(xiàn)。Pochonin D(PoD)能有效抑制三陰性乳腺癌(TNBC)細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和銅死亡。PRDX1是PoD的直接靶點(diǎn),PoD通過(guò)與PRDX1的Cys173位點(diǎn)共價(jià)結(jié)合,抑制其酶活性,干預(yù)銅死亡過(guò)程,發(fā)揮抗TNBC活性。PRDX1是與銅死亡相關(guān)的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),PoD是新型銅離子載體。
 
  研究的創(chuàng)新性:
 
  從植物內(nèi)生真菌中分離出9種新的RALs,化合物1 - 6具有特的E構(gòu)型,為化學(xué)研究提供新見(jiàn)解。
 
  發(fā)現(xiàn)PoD能誘導(dǎo)TNBC細(xì)胞銅死亡,且PRDX1是其作用靶點(diǎn),為T(mén)NBC治療提供新策略。
 
  PoD對(duì)PRDX1有高選擇性和良好體內(nèi)安全性,是研究PRDX1抑制機(jī)制的合適工具。
 
  研究的不足之處:
 
  雖發(fā)現(xiàn)PRDX1抑制劑可誘導(dǎo)銅離子積累,但未深入探究其具體過(guò)程和機(jī)制,缺乏更詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
 
  研究主要集中在細(xì)胞和小鼠模型,未開(kāi)展臨床試驗(yàn),PoD在人體中的療效和安全性有待進(jìn)一步研究。
 
  研究展望:
 
  深入研究PRDX1抑制劑誘導(dǎo)銅離子積累的具體分子機(jī)制,明確其在銅死亡中的作用。
 
  開(kāi)展PoD的臨床試驗(yàn),評(píng)估其在人體中的療效和安全性,為T(mén)NBC治療提供臨床依據(jù)。
 
  基于PoD和RALs的結(jié)構(gòu),進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和改造,開(kāi)發(fā)更高效、低毒的抗TNBC藥物。
 
  研究意義:
 
  本研究為T(mén)NBC治療提供了新的藥物靶點(diǎn)和治療策略。發(fā)現(xiàn)的新RALs和PoD為開(kāi)發(fā)新型抗癌藥物提供了基礎(chǔ)。明確PRDX1與銅死亡的關(guān)系,有助于深入理解TNBC的發(fā)病機(jī)制,為T(mén)NBC的精準(zhǔn)治療提供理論支持。
 


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