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全基因組測序解密慢性高原病

時間:2013-8-20閱讀:651
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由加州大學(xué)圣地亞哥分校、華大基因等單位共同完成的安第斯高地人慢性高原病全基因組測序及相關(guān)研究,在《美國人類遺傳學(xué)雜志》上發(fā)表。研究為探索高原適應(yīng)性的遺傳機(jī)制提供了基礎(chǔ)理論,也為慢性高山病的機(jī)理研究及治療提供了科學(xué)依據(jù)。

約有1.4億人世居高原。對于高原低氧環(huán)境的不適,通常會產(chǎn)生各種高原疾病,尤其生活在海拔3000米以上的人,通常會發(fā)生慢性高原病,表現(xiàn)為紅細(xì)胞增多,并出現(xiàn)一系列頭痛、乏力、嗜睡等癥狀。

研究人員對20個生活在高原地區(qū)的安第斯人進(jìn)行全基因組測序,其中包括10個慢性高原病患者和10個正常人。研究人員發(fā)現(xiàn)其基因組中,有11個區(qū)域存在明顯的單體型頻率差異并發(fā)生選擇性清除,暗示著這些區(qū)域受到強(qiáng)烈的正向自然選擇。在位于這些區(qū)域的基因中,相比于正常人群,在慢性高原病患者中ANP32D和SENP1兩個基因顯著高表達(dá)。同時還發(fā)現(xiàn),當(dāng)果蠅中ANP32D和SENP1的同源基因表達(dá)下調(diào)時,其在低氧環(huán)境下的存活率將顯著升高。據(jù)此,他們推測,這些基因表達(dá)下調(diào)可能有利于對低氧環(huán)境下的適應(yīng)和耐受。

研究人員發(fā)現(xiàn),慢性高原病患者負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)紅細(xì)胞生成的基因SENP1表達(dá)上調(diào),可能在導(dǎo)致慢性高原病患者紅細(xì)胞增多的癥狀中扮演了重要角色。此外,ANP32D是已知的原癌基因,研究人員推測在慢性高山病患者中,該基因以用類似于在癌細(xì)胞中的方式來改變細(xì)胞代謝,從而使得低氧環(huán)境下細(xì)胞大量增殖。這些發(fā)現(xiàn)同時還將有助于揭示類似環(huán)境下發(fā)生的疾病病理機(jī)制,如心臟病、阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征等。

科學(xué)家表示,通過強(qiáng)大的全基因組測序技術(shù)、體外培養(yǎng)的人細(xì)胞模型和果蠅活體模型的有機(jī)結(jié)合,不僅能夠鑒定出與缺氧耐受相關(guān)的基因,同時也對這些基因的功能進(jìn)行了系統(tǒng)的評估。這種研究策略將可用于發(fā)現(xiàn)更多疾病的致病基因。

 

來源:科技日報

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