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轉(zhuǎn)錄組水平分析子宮內(nèi)膜容受性

時間:2015-11-24閱讀:426
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子宮內(nèi)膜容受性是哺乳動物胚胎成功著床*的。然而,遺傳信息的缺乏仍然是理解奶山羊從接受前期子宮內(nèi)膜(PE)發(fā)育成接受期子宮內(nèi)膜(RE)過程中潛在機(jī)制的一個障礙。

在這項研究中,西北農(nóng)林科技大學(xué)動物科技學(xué)院曹斌云教授課題組采用轉(zhuǎn)錄組測序獲取超過4千萬高質(zhì)量的讀段,通過de novo組裝獲得了102,441unigenes。使用已知數(shù)據(jù)庫對這些unigenes進(jìn)行注釋??偣灿?/span>3,255unigenesPERE中差異表達(dá)(DEGs)(P值<0.05)。此外,還鑒定出76,729~77,102個假定的SNPs12,837SSRs。進(jìn)一步生物信息學(xué)分析DEGs,揭示許多生物學(xué)過程和通路可能涉及RE建立,特別是包括GO項:蛋白水解,細(xì)胞凋亡,細(xì)胞黏附,以及KEGG通路:細(xì)胞周期和細(xì)胞外基質(zhì)(ECM-受體相互作用。研究人員推測,ADCY8,VCAN,SPOCK1THBS1,和THBS2可能在子宮內(nèi)膜容受性發(fā)育中發(fā)揮重要作用。

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