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當(dāng)前位置:上海卡努生物科技有限公司>>公司動(dòng)態(tài)>>轉(zhuǎn)錄組水平分析子宮內(nèi)膜容受性
子宮內(nèi)膜容受性是哺乳動(dòng)物胚胎成功著床*的。然而,遺傳信息的缺乏仍然是理解奶山羊從接受前期子宮內(nèi)膜(PE)發(fā)育成接受期子宮內(nèi)膜(RE)過(guò)程中潛在機(jī)制的一個(gè)障礙。
在這項(xiàng)研究中,西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院曹斌云教授課題組采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲取超過(guò)4千萬(wàn)高質(zhì)量的讀段,通過(guò)de novo組裝獲得了102,441個(gè)unigenes。使用已知數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)這些unigenes進(jìn)行注釋??偣灿?/span>3,255個(gè)unigenes在PE和RE中差異表達(dá)(DEGs)(P值<0.05)。此外,還鑒定出76,729~77,102個(gè)假定的SNPs和12,837個(gè)SSRs。進(jìn)一步生物信息學(xué)分析DEGs,揭示許多生物學(xué)過(guò)程和通路可能涉及RE建立,特別是包括GO項(xiàng):蛋白水解,細(xì)胞凋亡,細(xì)胞黏附,以及KEGG通路:細(xì)胞周期和細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)-受體相互作用。研究人員推測(cè),ADCY8,VCAN,SPOCK1,THBS1,和THBS2可能在子宮內(nèi)膜容受性發(fā)育中發(fā)揮重要作用。
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