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技術文章

DNA拓撲異構(gòu)酶

點擊次數(shù):474 發(fā)布時間:2013-8-20

DNA拓撲異構(gòu)酶的概念
DNA拓撲異構(gòu)酶為催化DNA拓撲學異構(gòu)體相互轉(zhuǎn)變的酶之總稱,催化DNA鏈斷開和結(jié)合的偶聯(lián)反應。

DNA拓樸異構(gòu)酶的分類
按照拓撲異構(gòu)酶將閉環(huán)狀雙鏈DNA異構(gòu)體化的方式,拓撲異構(gòu)酶可分為兩種方式:

DNA拓撲異構(gòu)酶

Ⅰ型拓撲異構(gòu)酶(top-oisomeraseⅠ):切斷一個鏈而改變DNA的拓撲結(jié)構(gòu)的異構(gòu)化方式,屬于此類的有如大腸桿菌的ω蛋白(ω-protein,由分子量11萬的單個多肽鏈所成)及各種真核細胞中存在的切斷-結(jié)合酶(nicking-closing enzyme,分子量約6萬5千—7萬的及分子量約10萬的)。Ⅰ型拓撲異構(gòu)酶不需要ATP的能量而催化異構(gòu)體化,作為反應的中間產(chǎn)物,在原核生物來說是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價鍵,而真核生物是3′-OH末端5′-磷酸末端與酶形成共價鍵。此酯鍵中所貯存的能量,可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。Ⅰ型拓撲異構(gòu)化酶催化的反應有下列各種:使超螺旋DNA在每一切斷—結(jié)合反應中,使L數(shù)(參見DNA拓撲學異構(gòu)體)發(fā)生一種變化,即松弛(relaxation)(圖1)。將互補的單鏈環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變成具有螺旋結(jié)構(gòu)的雙鏈環(huán)狀DNA(圖 2),使單鏈DNA打結(jié)(topological knot)或解結(jié)(圖3)。另外在二個環(huán)狀雙鏈DNA一個分子的一個鏈切斷時,形成鏈環(huán)狀二聚體的分子(ca-tenane)。真核細胞的拓撲異構(gòu)酶Ⅰ,參與核小體的形成,細菌的ω蛋白參與轉(zhuǎn)錄和某種轉(zhuǎn)位子的插入。
Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶(top-oisomeraseⅡ):通過切斷DNA的兩條鏈來進行拓撲異構(gòu)化。Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶,有存在于細菌中的DNA促旋酶、噬菌體T4的拓撲異構(gòu)酶Ⅱ以及真核細胞中依賴ATP的拓撲異構(gòu)酶Ⅱ等。在Ⅱ型拓撲異構(gòu)酶中,DNA促旋酶可單獨催化閉環(huán)狀DNA產(chǎn)生超螺旋,這是*的。其它二個型的酶,除可使超螺旋松弛也需要ATP的能量外,還可催化促旋酶的催化反應。促旋酶和T4拓撲異構(gòu)酶Ⅱ參與DNA的復制和轉(zhuǎn)錄過程。
另外,噬菌體λ的irt基因產(chǎn)物和噬菌體φX174的基因A的產(chǎn)物等也具有切斷—結(jié)合酶的活性,可認為是拓撲異構(gòu)酶之一種。

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