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上海科興提供iPS細(xì)胞的遺傳缺陷

時(shí)間:2012-6-6閱讀:373
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近日生物學(xué)期刊《自然》(Nature)雜志同期發(fā)表了三篇論文分別針對(duì)iPS細(xì)胞的點(diǎn)突變、拷貝數(shù)變異及DNA甲基化特征進(jìn)行了研究,新研究發(fā)現(xiàn)或?qū)⒋偈寡芯咳藛T更審慎地利用iPS細(xì)胞開(kāi)展干細(xì)胞研究及臨床應(yīng)用。

 *篇:Hussein及同事研究了iPS細(xì)胞的基因組完整性。利用一種高分辨單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析技術(shù)平臺(tái),他們比較了大量人類(lèi)胚胎干細(xì)胞(ESC)系、人類(lèi)iPS細(xì)胞系以及起源的成纖維細(xì)胞系之間存在的拷貝數(shù)變異(CNV)的差異。研究人員證實(shí)相對(duì)于胚胎干細(xì)胞,iPS細(xì)胞有著更多的拷貝數(shù)變異,然而隨著細(xì)胞傳代這些變異數(shù)量逐漸減少。作者們證實(shí)在重編程過(guò)程中高比例地形成CNVs導(dǎo)致了早期幾代iPSC細(xì)胞群中的遺傳鑲嵌現(xiàn)象。在細(xì)胞增殖過(guò)程中,快速選擇淘汰了具有大量CNVs的細(xì)胞,從而使得iPSCs在晚期幾代中逐漸與胚胎干細(xì)胞相似。然而,作者謹(jǐn)慎地表示某些CNVs有可能為細(xì)胞提供了選擇利益。

第二篇:Lister等利用鳥(niǎo)槍法測(cè)序技術(shù)以單堿基分辨率在iPSCs, ESCs,體細(xì)胞以及由多能細(xì)胞分化的細(xì)胞中進(jìn)行了全基因組DNA甲基化測(cè)定。研究人員發(fā)現(xiàn)盡管iPSCs和ESCs的甲基化組存在大量相似之處,然而研究的5個(gè)iPS細(xì)胞系與ESCs還是有著顯著的差異,某些差異甚至在分化后持續(xù)存在。而iPSCs之間的差異則體現(xiàn)在細(xì)胞中的甲基化標(biāo)記上,這些甲基化標(biāo)記代表了起源的體細(xì)胞類(lèi)型的“記憶”效應(yīng)以及其他一些iPSC特異性改變。值得注意的是這些細(xì)胞系之間顯示出了差異的甲基化區(qū)域(表明某些區(qū)域尤其易于發(fā)生異常的重編程)。在著絲粒和端粒附近的巨堿基區(qū)域顯示了非CG序列甲基化改變,與轉(zhuǎn)錄及組蛋白甲基化中的改變相關(guān)。

第三篇:Gore等針對(duì)來(lái)自7個(gè)實(shí)驗(yàn)室利用5種不同方法誘導(dǎo)人類(lèi)成纖維細(xì)胞生成的22種iPS細(xì)胞系進(jìn)行了外顯子組測(cè)序。研究人員在這些iPS細(xì)胞中確認(rèn)了124個(gè)點(diǎn)突變,由此他們推測(cè)出每個(gè)iPS細(xì)胞基因組中約存在6個(gè)編碼區(qū)突變。值得注意的是,他們鑒別了多個(gè)有可能改變蛋白質(zhì)功能的錯(cuò)義突變,同時(shí)發(fā)現(xiàn)一些點(diǎn)突變富集于與癌癥相關(guān)的基因中。研究人員利用超深度測(cè)序(ultradeep sequencing)證實(shí)約一半的突變以低水平存在于起源的成纖維細(xì)胞群中,而另一半則發(fā)生在重編程過(guò)程中或之后。作者們認(rèn)為這些突變負(fù)荷有可能是在重編程和培養(yǎng)過(guò)程中受到了選擇作用而并非重編程固有誘變作用的影響。

     ips細(xì)胞在整個(gè)實(shí)驗(yàn)當(dāng)中都是起著和決定著一項(xiàng)研究的重大作用,它容不得半年的錯(cuò)誤,和瑕疵,在生物界,細(xì)胞餓研究將成為世界的主打!

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