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霍亂弧菌熒光PCR檢測試劑盒使用說明書

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 一、外標準模板DNA的制備

注:如果不需要自己制作濃度的標準曲線,此步可省略。如果不使用外標準模板,只能使用根據經驗值得到的標準曲線方程。

1、 挑取單個陽性菌落,如569B、El Tor N16961、O139 MO45等(注意:本產品A型需用O1霍亂弧菌做陽性對照、B型需用O139霍亂弧菌做陽性對照)于LB 液體培養(yǎng)基中,在37搖床培養(yǎng)10 小時,然后顯微鏡下計算細菌的濃度。注意:由于所有陽性霍亂弧菌都有傳染性,所以本公司不提供,需要用戶自備。

2、 用自選方法抽提培養(yǎng)的陽性對照細菌的基因組DNA。注意:提取陽性細菌的方法應該與提取樣品細菌的方法相同。

3、 用紫外分光光度計測定純化所得陽性菌DNA的濃度和純度,并計算出DNA量跟陽性細菌數的對應關系,即1 ug 陽性菌DNA對應多少陽性細菌。

4、 將純化的陽性菌DNA 用超純水用10倍系列稀釋法稀釋成到7個濃度梯度(相當于101-107 cfu/mL),充分混勻后放冰上待用。

 

二、樣品DNA的制備

1、 用自選方法抽提樣品細菌的基因組DNA。注意:使用的方法應該跟上步提取陽性菌的方法相同。

 

三、熒光定量PCR20uL體系)

1、 樣品管:在PCR管中加入下列成分:

成分

加入量

PCR MagicMix 2.0

10 uL

PCR級綠如藍染料

1 uL

待檢測樣品DNA(自備

X

O1專一性PCR引物對(僅本產品A型提供)

O139專一性PCR引物對(僅本產品B型提供)

2 uL

1×ROX染料自備、見注

2 uL

補水到

20 uL

注:僅ABI7500、77007900儀器需要使用ROX作為對照,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQMJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000LightCycler480)不需要使用ROX作對照。

2、 陰性對照共兩管:一管用非霍亂弧菌的基因組DNA作為模板(可用實驗室常用的BL21DH5a大腸桿菌的基因組DNA);另一管用水作為模板。兩個陰性對照可以檢驗PCR反應的特異性。

3、 外標準反應共七管:用上步制備的7個濃度梯度的陽性菌DNA分別作為7個熒光PCR反應的模板。

 

四、熒光PCR反應參數:

過程

溫度

時間

其他要求

預變性

95℃

3 分鐘

 

PCR反應一

10個循環(huán))

95℃

10 s

 

58

20 s

每次循環(huán)溫度降低1

72

15 s

 

PCR反應二

40個循環(huán))

95℃

10 s

 

55

20 s

在此步收集反應的熒光數據,所選擇波長見注。

72

15 s

 

 

注:本產品所用熒光染料跟DNA結合時的zui大光吸收是500nm,zui大發(fā)射波長是530nm,不跟DNA結合時zui大吸收波長是471 nm,無發(fā)射。

 

五、數據處理

1、 7個濃度的陽性菌標準樣品所得的數據制作標準曲線,以細菌數的log為橫軸,以熒光PCR反應的Ct值為縱軸。如果沒有自己制作標準曲線,可以用本試劑的經驗標準方程:Y=-3.68lgX)+37.48, R2=0.99971。

通過樣品DNA熒光PCRCt值反推出待測樣品中的霍亂弧菌的數量:將樣品DNA熒光PCRCt值作為Y值放入標準曲線方程式中即可計算出XPCR體系中霍亂弧菌的數量)。

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