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中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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培養(yǎng)基
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我國顏寧課題組從結(jié)構(gòu)上揭示人Ptch1蛋白識(shí)別Shh機(jī)制

時(shí)間:2018/12/18閱讀:1162
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經(jīng)預(yù)測長1447個(gè)氨基酸殘基的人Ptch1蛋白含有12個(gè)跨膜區(qū)段(TM),并且與細(xì)菌RND家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(resistance-nodulation-division family transporter, RND家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白)存在著結(jié)構(gòu)類似性。Ptch1的跨膜區(qū)段2(TM2)至TM6構(gòu)成固醇敏感多肽區(qū)(sterol-sensing domain, SSD)。人們已在幾種參與固醇轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝的蛋白中發(fā)現(xiàn)了SSD。這些含有SSD的蛋白的潛在固醇結(jié)合或轉(zhuǎn)運(yùn)活性的分子機(jī)制仍然是不清楚的。

在一項(xiàng)新的研究中,為了獲得適合于結(jié)構(gòu)研究的樣品,來自中國清華大學(xué)的研究人員基于序列保守性和功能表征獲得幾種人Ptch1的構(gòu)建體。終,在人胚胎腎293F細(xì)胞中瞬時(shí)表達(dá)的含有氨基酸殘基1~1305的人Ptch1截短版本在親和層析純化和尺寸排阻層析純化后表現(xiàn)出 足夠的表達(dá)水平和良好的溶液行為。他們還觀察了Ptch1的寡聚體狀態(tài)和單體狀態(tài)。Ptch1的單體形式可適用于單粒子低溫電子顯微鏡分析,

在三種哺乳動(dòng)物Hh同源物Sonic(Shh)、Desert(Dhh)和Indian(Ihh)中,Shh一直是功能和機(jī)制研究的原型。在大腸桿菌中表達(dá)和純化的人Shh的N-端結(jié)構(gòu)域(ShhN, 氨基酸殘基24~197)能夠在琥珀酸單酯(cholesteryl hemisuccinate, CHS)的存在下與去污 劑溶解的Ptch1蛋白形成一種穩(wěn)定的復(fù)合物。

顏寧課題組分別在3.9埃分辨率下和在3.6埃分辨率下解析出人Ptch1單獨(dú)時(shí)以及它與ShhN結(jié)合在一起時(shí)的低溫電鏡結(jié)構(gòu)。他們識(shí)別出兩個(gè)相互作用的胞外結(jié)構(gòu)域ECD1和ECD2,以及12個(gè)跨膜區(qū)段(TM1~12)。一旦ShhN結(jié)合,ECD1和ECD2向彼此移動(dòng),而且它們一起構(gòu)成ShhN 的停靠位點(diǎn)。顏寧課題組對(duì)ShhN與Ptch1之間的詳細(xì)識(shí)別進(jìn)行了分析和生化驗(yàn)證。

在具有或不具有ShhN的Ptch1中觀察到兩個(gè)與CHS相一致的類固醇密度(steroid-shaped density):一個(gè)在由這兩個(gè)胞外結(jié)構(gòu)域包圍的口袋中,另一個(gè)在SSD的膜面向的腔中?;诮Y(jié)構(gòu)的生化分析揭示出ShhN和Ptch1之間的類固醇依賴性相互作用。相比于野生型Ptch1,類 固醇結(jié)合缺陷型Ptch1突變體的結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出顯著的構(gòu)象重排。

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