主要儀器
研缽,恒溫水浴,旋渦振蕩器,冷凍臺式高速離心機(jī),
超低溫冰箱,紫外檢測儀,電泳儀,電泳槽。
試劑
1.Trizol試劑(購自invitrogen公司)
2.焦碳酸二乙酯(DEPC)
3.氯仿(新開封)
4.異丙醇(新開封)
5.無RNAse滅菌水:用將高溫烘烤的玻璃瓶(250℃ 3小時)裝蒸餾水,然后加入0.1%的DEPC(體積/體積),處理過夜后高壓滅菌。
6.75%乙醇:用DEPC處理后的水配制75%乙醇,(用高溫滅菌器皿配制),然后裝入高溫烘烤的玻璃瓶中,存放于4℃冰箱。
相關(guān)器皿的預(yù)處理
1.塑料制品的處理
盡可能使用無菌,一次性塑料制品,已經(jīng)標(biāo)明RNase-Free的塑料制品,如果沒有開封使用過通常沒有必要再次處理。對于國產(chǎn)塑料制品,原則上都必須處理方可使用。處理步驟如下:
1)在玻璃燒杯中注入去離子水,加入DEPC使其終濃度為0.1%。注意:DEPC為劇毒物質(zhì),活性很強(qiáng),應(yīng)在通風(fēng)櫥中小心使用。
2)將需要處理的塑料制品放入一個可以高溫滅菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。
3)在通分櫥中室溫處理過夜。
4)將DEPC水溶液小心倒入廢液瓶中,用鋁箔封住含有已用DEPC水處理過的塑料制品的容器,高溫高壓蒸汽滅菌至少30 min。
5)在烘箱中用合適的溫度烘烤至干燥。置于干凈處備用。
2.玻璃和金屬制品
先用去離子水將器皿清洗干凈,晾干,用鋁箔包好,然后至烘箱中250℃烘烤3 小時以上。
操作步驟
*部分 勻漿
A 從組織中提取總RNA、
1)液氮研磨:組織塊直接放入研缽中,加入少量液氮,迅速研磨,待組織變軟,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按照每50~100mg組織加入1ml Trizol,轉(zhuǎn)入離心管進(jìn)行下步操作。
2)勻漿:用電動勻漿器充分勻漿1~2min。注意,組織樣品體積不能超過Trizol體積的10%,否則勻漿效果會不好。
B 從培養(yǎng)細(xì)胞中提取總RNA
1)粘壁培養(yǎng)細(xì)胞:不需蛋白酶消化,先將培養(yǎng)基去除,然后直接將Trizol加入到培養(yǎng)瓶中消化、裂解細(xì)胞,Trizol體積按10cm2/ml的比例加入。
2)懸浮培養(yǎng)細(xì)胞:直接離心收集細(xì)胞后用Trizol重懸、裂解,每1ml Trizol可裂解5×106個動物、植物或酵母細(xì)胞,或1×107個細(xì)菌細(xì)胞。注意,在加入Trizol之前不能用其他緩沖液洗滌細(xì)胞,那樣會增加mRNA降解的可能性。另外,在裂解酵母或細(xì)菌細(xì)胞時可以借助勻漿器。
第二部分 相分離
1.勻漿組織加入Trizol后,室溫放置5min,使其充分裂解。注意:此時可以放入-70℃保存。
2.室溫,12000 r/min,離心5 min。取上清于一新管。
3.按照1ml Trizol加入200µl氯仿,用手振蕩混勻后室溫放置2~3 min。注意:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂。
4.4℃,12000 r/min,離心15 min。小心吸取上層水相于一新管。注意:千萬不要吸取中間界面;若同時提取DNA和蛋白質(zhì),則保留下層酚相存于4℃冰箱中,如只提取RNA,則棄下層酚相。
第三部分 RNA沉淀
5.按照1ml Trizol加入異丙醇0.5 ml,混勻,室溫放置5~10 min。
6.4℃,12000 r/min,離心15min。棄上清,RNA沉淀管底。注意:RNA沉淀在離心之前是不可見的,常常在離心管的邊緣或者底部形成凝膠狀小球。
第四部分 RNA洗滌