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當(dāng)前位置:上海隆壘生物科技有限公司>>公司動態(tài)>>大型癌細(xì)胞系治療信息數(shù)據(jù)庫
在發(fā)表于《細(xì)胞》(Cell)雜志上的新研究論文中,Schreiber和Broad研究所的同事對這一門戶進(jìn)行了描述,指出其中包含的信息是通過測量240種癌細(xì)胞系對于超過350種靶向細(xì)胞回路不同節(jié)點(diǎn)的化合物的反應(yīng)而獲得。這些細(xì)胞系來自許多不同種類的腫瘤,另一項(xiàng)稱作為癌細(xì)胞系百科全書(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互補(bǔ)研究已經(jīng)確定了這些細(xì)胞系的基因組特征。在美國國家癌癥研究所癌癥靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和開發(fā)(CTD2)項(xiàng)目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共數(shù)據(jù),其中包含了有關(guān)每個(gè)癌細(xì)胞系突變、基因表達(dá)和其他基因組改變的信息。
Schreiber和同事們證明,研究中的這組化合物可以用來發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞系從前未檢測到的依賴性。隨著正常細(xì)胞一步步地變?yōu)榘┘?xì)胞,它會累積大量的促癌遺傳改變,使得細(xì)胞能夠不受控制地分裂和存活。此外,在癌癥形成的過程中,其他通常在細(xì)胞中發(fā)揮無害作用的基因有可能變得對癌癥生存至關(guān)重要。通過讓細(xì)胞系暴露于不同的化合物中,研究人員能夠揭示癌細(xì)胞生存所必需的蛋白質(zhì),并有可能提供新的治療靶點(diǎn)。
在他們的論文中,Schreiber和同事們描述了一個(gè)如何利用CTRP來發(fā)現(xiàn)候選依賴性的例子。研究小組發(fā)現(xiàn)一種在小細(xì)胞肺癌臨床試驗(yàn)中測試的藥物navitoclax,或許能夠尤其有效地靶向帶有CTNNB1突變的癌細(xì)胞系。CTNNB1突變存在于一些大腸癌、肝細(xì)胞癌、胃癌和子宮內(nèi)膜癌中。這只是一個(gè)關(guān)于CTRP如何能夠幫助揭示有用生物標(biāo)記物的例子,利用生物標(biāo)記物可以預(yù)測藥物反應(yīng)和耐藥。除了發(fā)現(xiàn)已開發(fā)藥物的新用途,CTRP還可用于鑒別新的治療靶點(diǎn)。
Broad研究所團(tuán)隊(duì)將繼續(xù)用新的數(shù)據(jù)填充CTRP,擴(kuò)大這一資源,包括在更大量癌細(xì)胞系上解析化合物或化合物組合。
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