葉克窮等蛋白質(zhì)Rrp9結(jié)構(gòu)域研究獲進(jìn)展
203年3月8日,北京生命科學(xué)研究所葉克窮實(shí)驗(yàn)室在《RNA》雜志在線發(fā)表題為“Structural and functional analysis of the U3 snoRNA binding protein Rrp9”的論文。
核糖體是翻譯蛋白質(zhì)的巨大的RNA蛋白質(zhì)復(fù)合物。在真核生物中,核糖體的合成需要一套非常復(fù)雜的保守的系統(tǒng),它包括約200個(gè)蛋白質(zhì)組裝因子和很多定位在核仁里的snoRNA。有一類(lèi)C/D snoRNA主要參與核糖體RNA的修飾。U3是特殊的C/D snoRNA,它和8S核糖體RNA的加工和核糖體小亞基的合成有關(guān)。C/D snoRNA通常和四個(gè)核心蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物,但U3還和蛋白質(zhì)Rrp9結(jié)合。Rrp9包括一個(gè)WD 結(jié)構(gòu)域和一段N端序列。WD 結(jié)構(gòu)域是個(gè)典型的蛋白質(zhì)結(jié)合結(jié)構(gòu)域,有趣的是Rrp9的WD 結(jié)構(gòu)域卻結(jié)合RNA。目前還不清楚Rrp9如何識(shí)別U3 RNA。
在這個(gè)工作中,作者利用蛋白質(zhì)晶體學(xué),生物化學(xué)和酵母系統(tǒng)分析了Rrp9的結(jié)構(gòu)和功能。他們解析了Rrp9 WD結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)它折疊成典型的7片螺旋漿結(jié)構(gòu)。通過(guò)突變分析,他們發(fā)現(xiàn)Rrp9用來(lái)結(jié)合RNA的一個(gè)重要結(jié)構(gòu)元件,該元件是U3 的特異識(shí)別,Rrp9在核仁的定位以及酵母生長(zhǎng)所必須的。他們還發(fā)現(xiàn)Rrp9的N端序列包括一個(gè)特殊的二元核定位信號(hào),但該信號(hào)對(duì)于核仁的定位并不是必須的。這些研究揭示了Rrp9的多個(gè)功能位點(diǎn)。
論文的*作者是我所和北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)的博士研究生張麗漫。林金鐘博士也參與了此研究工作。葉克窮博士是本文通訊作者。此項(xiàng)研究受中國(guó)科技部和北京市科委資助,在北京生命科學(xué)研究所完成。
葉克窮等蛋白質(zhì)Rrp9結(jié)構(gòu)域研究獲進(jìn)展