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人類基因組測序有望幾分鐘內(nèi)完成

2011年01月05日 09:55:51人氣:1051來源:上海天齊生物科技有限公司

        來自倫敦帝國理工學(xué)院的科學(xué)家正在開發(fā)一種技術(shù),它能夠在幾分鐘內(nèi)完成個人基因組的測序,且費用比目前的技術(shù)要低得多。研究人員已經(jīng)將這項原型技術(shù)申請,其研究成果發(fā)表在近期的《Nano Letters》雜志上。

        在這個新研究中,研究人員證明能在50 nm孔中利用電荷高速推動DNA鏈。當(dāng)DNA鏈出現(xiàn)在芯片后面時,它的編碼序列被一種電極隧道接頭讀取。電線之間的2 nm間隔支持一種電流,它能與每個堿基的不同電信號相互作用。然后,一臺強(qiáng)大的計算機(jī)能夠解析堿基的信號,以構(gòu)建出基因組序列。

        一直以來,因納米孔測序的高速和高通量,它被認(rèn)為是DNA測序技術(shù)的重大進(jìn)步。在典型的納米孔實驗中,生物分子在電力驅(qū)動下穿過一個外加電場的納米孔。這導(dǎo)致孔內(nèi)離子電流的特征性阻斷。通過分析,能提取出有關(guān)分子性質(zhì)的一些信息,如長度、成分以及與其他分子的相互作用。但是,目前基于粒子電流阻斷或熒光的檢測似乎還缺乏時空的分辨率,不能獲得結(jié)構(gòu)信息。

        而另一種基于DNA的隧道運輸?shù)臋z測方法有望打破這些限制。因其源于量子力學(xué),隧道電流隨距離迅速衰減,從而提高空間分辨率,還提供了分子的特異性。

        帝國理工學(xué)院化學(xué)系的Emanuele Instuli博士解釋了研究時面臨的挑戰(zhàn):“直到現(xiàn)在還很難對齊接頭和納米孔。此外,對這種尺寸電線的改造接近原子規(guī)模,實際上已達(dá)現(xiàn)有儀器的極限。然而,在實驗中,我們能夠讓兩個鉑電線進(jìn)入電極接頭,其間隔足夠小,讓電流能夠通過。”

        研究人員通過隧道光譜學(xué)鑒定出有功能的隧道裝置,隨后*次證明能在納米孔平臺上同時進(jìn)行隧道檢測和DNA分子的離子電流檢測。這是邁向超快DNA隧道測序的重要一步。

        與現(xiàn)有技術(shù)相比,這項技術(shù)有幾個明顯優(yōu)勢:納米孔測序很快、很簡單;硅芯片比目前使用的一些易損材料更耐用,它們能夠處理、洗滌、并重新使用很多次,而*不會折損其性能。

        作者之一,化學(xué)系Joshua Edel博士談到:“與目前的技術(shù)相比,這個裝置能夠帶來更廉價的測序:只需幾美元而已。我們還未試過全基因組測序,但是初期實驗表明理論上能夠在幾分鐘內(nèi)完成人類基因組的全基因組掃描。它顯然快得多,更可靠,且有望放大成一種裝置,每秒鐘讀取1千萬個堿基。”

關(guān)鍵詞:芯片
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