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微生物組樣本和人類來源聯系起來-齊一生物

時間:2015-5-12閱讀:179
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科研人員報告了用于識別人類微生物組樣本的*而穩(wěn)定的元基因組編碼。血型和基因組變異一直被用于在法醫(yī)鑒定、家譜和災難響應中鑒別個體,但是微生物組——見于每個人的微生物的構成的補體——迄今為止沒能提供*的識別特征,出現這種情況的原因部分是由于缺乏人群中的個體微生物組的可靠、穩(wěn)定而*的編碼。Curtis Huttenhower 及其同事開發(fā)了一種算法,從而根據身體不同部位的微生物物種和基因,建立元基因組編碼,并把這種算法應用到了來自人類微生物組工程招募的120人的樣本上。人類微生物組工程是一個研究人類微生物組的政府資助的協作體。這組作者僅僅根據身體部位特異性微生物組編碼,就從許多人中間準確分辨出了個體的微生物組。當對每個受試者訪問的30到300天后收集的樣本重復這一分析的時候,使用同樣的編碼可以一對一地識別出大約30%的樣本,幾乎沒有假陽性;在至多一年之后,使用大便樣本的重復分析正確識別出了大約80%的微生物組,這提示了來自腸道微生物組的編碼具有相對的穩(wěn)定性。這組作者說,由于微生物組庫的相當一部分樣本可能有潛力在數據庫中被一對一地識別出來,其中某些樣本可能含有敏感的個人信息,因此不能假定這類樣本具有*的匿名性。
原文檢索:Identifying personal microbiomes using metagenomic codes

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