來自美國(guó)斯坦福大學(xué)和加拿大英屬哥倫比亞大學(xué)（UBC）的研究人員通過研究發(fā)現(xiàn)，不同人群之間的DNA甲基化模式存在較大差異。該成果發(fā)表在zui近一期的《Genome Biology》雜志上。

在多細(xì)胞生物體中，細(xì)胞類型的巨大多樣性是由基因表達(dá)的可遺傳差異維持的，其中部分是由表觀遺傳學(xué)機(jī)制調(diào)控的，包括組蛋白修飾，組蛋白變異、RNA方面的機(jī)制和DNA甲基化。而DNA甲基化或許是目前了解得zui清楚的表觀遺傳學(xué)機(jī)制。
過去的研究發(fā)現(xiàn)，在多個(gè)CpG位點(diǎn)上，人類DNA甲基化存在種族差異，然而，這些差異的全基因組模式和程度在很大程度上還是未知的。此外，DNA甲基化多態(tài)性的遺傳控制是否是群體特異性的，也有待研究。

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在這項(xiàng)研究中，研究人員測(cè)定了180個(gè)細(xì)胞系中14,000多個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近的DNA甲基化，這些細(xì)胞系來自一個(gè)非洲群體和一個(gè)歐洲群體。他們先用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA，再利用Infinium HumanMethylation27 BeadChip芯片（Illumina公司）開展定量的DNA甲基化測(cè)定。之后，他們還開展焦磷酸測(cè)序，證實(shí)了PLSCR2和IGSF2啟動(dòng)子區(qū)域的DNA甲基化。
他們發(fā)現(xiàn)，在所有基因中，超過1/3的DNA甲基化存在群體特異的模式。此外，盡管超過1000個(gè)CpG位點(diǎn)的甲基化是可遺傳的，但不同群體之間的遺傳性也存在差異，表明DNA甲基化的遺傳控制存在分歧。
為了支持這一點(diǎn)，研究人員對(duì)DNA甲基化進(jìn)行了遺傳定位。結(jié)果表明，大部分群體特異性可由群體之間等位基因頻率的分歧來解釋，并且群體之間的遺傳關(guān)聯(lián)幾乎不重疊。幾百個(gè)大腦樣品的DNA甲基化模式支持了這些群體特異的遺傳關(guān)聯(lián)。
研究結(jié)果表明，群體之間的DNA甲基化是高度分歧的，而這種分歧在很大程度上要?dú)w因于等位基因頻率的差異以及上位或基因與環(huán)境的復(fù)雜相互作用。

由于DNA甲基化是一個(gè)重要的表觀遺傳修飾，影響了多種疾病及其他表型，而此項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了可影響表觀遺傳修飾的因素間的復(fù)雜相互作用。作者認(rèn)為，這些因素的進(jìn)一步鑒定將對(duì)了解表觀基因組很關(guān)鍵。

來源：生物通