深圳子科生物報道:近日,中國科學(xué)院昆明動物研究所孔慶鵬課題組研究發(fā)現(xiàn)裸鼴鼠的抗癌特性與長鏈非編碼RNA密切相關(guān),相關(guān)成果發(fā)表在《表觀遺傳學(xué)與染色質(zhì)》期刊上。
據(jù)了解,裸鼴鼠是嚙齒類動物中名副其實的長壽之星,其壽命可長達30年,而一般小鼠及大鼠的壽命僅有2~3年。此外,裸鼴鼠還具有天然的抗癌特性,因此裸鼴鼠在長壽和腫瘤研究領(lǐng)域受到極其廣泛的關(guān)注。長鏈非編碼RNA(LncRNA)被定義為長度大于200bp而不具備編碼蛋白潛能的轉(zhuǎn)錄本,過去認為lncRNA只是基因組中的junk DNA,如今發(fā)現(xiàn)lncRNA不僅能調(diào)控發(fā)育和基因表達,更是與諸多老年疾?。ㄈ缋夏臧V呆、腫瘤等)的發(fā)生息息相關(guān)。
以往,由于技術(shù)的限制以及l(fā)ncRNA序列在物種間呈現(xiàn)低保守性等原因,lncRNA的鑒定和分析都存在較多的困難。然而,二代測序技術(shù)以及生物信息學(xué)的快速發(fā)展使得科研人員可以快速、準確地挖掘不同物種的lncRNA序列,并對其功能進行有效的預(yù)測。
孔慶鵬課題組以裸鼴鼠為研究對象,建立了一套嚴格的lncRNA鑒定流程,從裸鼴鼠基因組中成功鑒定出4422條高質(zhì)量lncRNA,并發(fā)現(xiàn)裸鼴鼠的lncRNA具有表達豐度低、組織特異性強及保守性低等特點;通過共表達分析對裸鼴鼠的lncRNA功能進行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)大約61.93%的裸鼴鼠lncRNA與抑癌基因表達高度相關(guān)。
科研人員進一步分析發(fā)現(xiàn),裸鼴鼠的lncRNA與透明質(zhì)酸相關(guān)基因存在較高的共表達關(guān)系,而透明質(zhì)酸已被證實是裸鼴鼠具備抗癌特性的關(guān)鍵物質(zhì)。該結(jié)果提示,裸鼴鼠的lncRNA可能通過調(diào)控透明質(zhì)酸的生成,使得其擁有天然的抗癌特性。