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上海士鋒生物科技有限公司
中級會(huì)員 | 第14年

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標(biāo)準(zhǔn)品
培養(yǎng)基
培養(yǎng)基原料 霍亂弧菌診斷血清 大腸艾希氏菌診斷血清 志賀氏菌屬診斷血清 沙門氏菌屬診斷血清 標(biāo)準(zhǔn)血清,診斷血清 抗生素藥敏紙片 微生物配套試劑 微生物生化管 管裝培養(yǎng)基 即用型液體培養(yǎng)基 一次性培養(yǎng)基平板 顯色培養(yǎng)基 臨床培養(yǎng)基 菌種保存培養(yǎng)基 四環(huán)素檢定、厭氧亞硫酸鹽還原桿菌檢測培養(yǎng)基 維生素檢測培養(yǎng)基 一次性衛(wèi)生用品衛(wèi)生檢測培養(yǎng)基 罐頭食品商業(yè)無菌檢測培養(yǎng)基 飲用水及水源檢測培養(yǎng)基 藥品、生物制品檢測培養(yǎng)基 化妝品檢測培養(yǎng)基 動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)基 啤酒檢驗(yàn)培養(yǎng)基 軍團(tuán)菌檢測培養(yǎng)基 支原體檢測培養(yǎng)基 小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 彎曲桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 產(chǎn)氣莢膜梭菌、肉毒梭菌、厭氧菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 阪崎腸桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 溶血性鏈球菌檢測培養(yǎng)基 李斯特氏菌檢測培養(yǎng)基 弧菌檢測培養(yǎng)基 乳酸菌、雙歧桿菌檢測培養(yǎng)基 酵母、霉菌檢測培養(yǎng)基 檢測培養(yǎng)基 沙門氏菌、志賀氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 大腸菌群、糞大腸菌群、大腸桿菌及腸桿菌科檢測培養(yǎng)基 細(xì)菌總數(shù)檢測,增菌培養(yǎng)基
抗體
生物試劑
細(xì)胞
菌株
血清
細(xì)胞分離試劑
試劑盒

測序常見問題分析

時(shí)間:2016/3/30閱讀:834
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1.如何測定引物的OD值? 
用紫外分光光度計(jì)在260nm波長測定溶液的吸光度來定量,請注意紫外分光光度計(jì)的使用,測定時(shí)溶液的吸光度稀釋到0.2-0.8之間(吸光度太高或太低會(huì)有較大的誤差)。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,取部分溶液稀釋到1ml并在1ml標(biāo)準(zhǔn)比色皿中測定其吸光度,即為所測體積的OD值,進(jìn)而可以計(jì)算出母液的OD值。 
舉例:您拿到一管干粉的DNA,用1ml水溶解成母液,取該母液50μL稀釋成1ml并在1ml標(biāo)準(zhǔn)比色杯中測定的吸光度為0.25,說明該50μL中含有0.25OD的DNA,也即說明原來1ml母液中含有5OD的DNA。 

2.怎樣溶解引物? 
我們的的合成報(bào)告單給出了每OD引物稀釋為100μmoL/L(即100pmol/ul)濃度的加水量,您可以根椐您的實(shí)驗(yàn)需要加入適量的無核酸酶的雙蒸水(PH>6.0)或TE緩沖液(PH 7.5-8.0),開啟瓶蓋溶解之前在3000-4000轉(zhuǎn)/分鐘 的轉(zhuǎn)速下離心1分鐘,防止開蓋時(shí)引物散失。 

3.合成的引物應(yīng)如何保存?
沒有溶解的引物非常穩(wěn)定,可以在-20℃下保存至少1年,溶解好的引物可以事先稀釋為100μmoL/L的儲(chǔ)存液,分裝數(shù)份保存于-20℃冰箱,可以保存至少半年以上(反復(fù)多次凍融會(huì)降低使用壽命)。使用前,將濃溶液稀釋成工作液(10 pmol/ml或20 pmol/ml)后進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。 

4.如何檢測引物的純度? 
實(shí)驗(yàn)室方便的作法是用PAGE方法。使用加有7M尿素的一定濃度的聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳,<12個(gè)堿基的引物用20%的膠,12-60個(gè)堿基的引物用16%的膠,>60個(gè)堿基的引物用12%的膠,取0.2OD左右的引物,用尿素飽和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到飽和,上樣前加熱變性(95oC,2mins)。加入尿素的目的一是變性,二是增加樣品比重,容易加樣。600V電壓進(jìn)行電泳,一定時(shí)間后(約2-3小時(shí)),剝膠,用熒光TLC板在紫外燈下檢測帶型,在主帶之下沒有雜帶,說明純度是好的(有時(shí)由于變性不充分,主帶之上可能會(huì)有條帶,乃是引物二級結(jié)構(gòu)條帶)。 

5.一般的合成的引物在5"和3"末端有磷酸基團(tuán)嗎?
沒有,5"和3"末端均為-OH基。如需要加磷酸基團(tuán),訂貨時(shí)請?zhí)貏e注明,此時(shí)需收取磷酸化的費(fèi)用。 

6.合成的引物進(jìn)行pcr反應(yīng)時(shí)無目的帶,怎么辦?
PCR反應(yīng)失敗的原因很多,可以從以下幾個(gè)方面考慮。 
1) 引物和模板是否配對,同源性有多大?
2) 引物本身是否有立體結(jié)構(gòu).
3) PCR反應(yīng)用試劑是否能正常工作?
4) PCR儀是否工作正常?
5) PCR反應(yīng)條件是否合適?
如果一切正常,還無法解決問題時(shí),我們可以免費(fèi)重新合成引物。 

7.測定了引物的OD值后發(fā)現(xiàn)A260/A280<1.8,引物的純度合格嗎?
由于核酸在260nm附近有強(qiáng)吸收,而蛋白質(zhì)在280nm附近有強(qiáng)吸收,從生物體內(nèi)提取核酸時(shí),常用A260/A280比值來評價(jià)核酸純度(比值在1.8~2.0之間),這一判斷是基于序列中A、G、C、T所占比例大致相同時(shí)的結(jié)果。而合成的DNA/RNA則不同,序列很短 (通常在20~30個(gè)堿基之間),其中A、G、C、T各種堿基所占比例很不相同,由于各種堿基的摩爾消光系數(shù)不同,因此不同堿基構(gòu)成的引物的A260/A280比值也不同, 例如當(dāng)序列中C、T堿基的含量高時(shí),該比值會(huì)大大低于1.8。所以不能用A260/A280的比值來判斷引物的純度.

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