非編碼小分子RNA可以預(yù)測出某個(gè)人是否患有乳腺癌，致力于癌癥基因組圖譜計(jì)劃的研究人員得出這一結(jié)論。這一結(jié)果發(fā)表在《EMBO Reports》，指出特定類型的非編碼RNA水平的差異可以用來區(qū)別癌和非癌組織。這些RNA也可用于把癌癥患者分成具有不同的生存結(jié)果的亞群。
        小非編碼RNA是不產(chǎn)生蛋白質(zhì)的RNA分子，但在細(xì)胞中也有其它重要的功能。“多年來，由于其明顯的混沌分布以及無法將這些分子與已知功能或疾病相關(guān)聯(lián)，轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近的非編碼小分子RNA被視為‘轉(zhuǎn)錄噪音’”加拿大西蒙弗雷澤大學(xué)和不列顛哥倫比亞大學(xué)教授，加拿大卑詩省癌癥研究中心杰出的科學(xué)家，該研究的牽頭作者Steven Jones說。“通過使用計(jì)算方法來分析我們生成的小RNA序列信息（癌癥基因組圖譜計(jì)劃的一部分），我們已經(jīng)能夠通過過濾這個(gè)“轉(zhuǎn)錄噪音”，發(fā)現(xiàn)臨床上有用的信息，”Jones補(bǔ)充說。“我們的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表明，蛋白質(zhì)編碼基因的*個(gè)外顯子的小非編碼RNA在表達(dá)水平中的全基因組變化與乳腺癌相關(guān)。”
        科學(xué)家們能夠區(qū)分健康人和乳腺癌患者的基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近的眾多不同的小非編碼RNA。他們確定這些RNA分子在DNA序列的特定位置，并尋找被強(qiáng)烈表達(dá)的非編碼RNA與乳腺癌患者的相關(guān)性。然后，研究人員測試在基因組位置上表達(dá)的小RNA，是否可以用來從另一組已知具有乳腺癌的患者組織樣本中預(yù)測疾病。“預(yù)測癌癥的可能性被限制在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近發(fā)現(xiàn)的，許多小的、非編碼RNA的一個(gè)子集。更重要的是，這些RNA位點(diǎn)高度富集CpG島，”研究報(bào)告的*作者Athanasios Zovoilis說。 CpG島是含有胞嘧啶和*的高頻基因組區(qū)域。這些島出現(xiàn)RNA，表明他們可能參與DNA甲基化過程和疾病的發(fā)作，但需要額外的探索實(shí)驗(yàn)來證明此關(guān)系。
        “這是*次發(fā)現(xiàn)基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近的非編碼小分子RNA與疾病有關(guān)，”Jones說。“盡管需要更深入的研究，但根據(jù)我們的數(shù)據(jù)，相信這些小的非編碼RNA有相當(dāng)大的潛力作為預(yù)測工具用于癌癥的診斷。此外，它們還可以幫助我們?cè)诒碛^遺傳水平更好地了解底層腫瘤的發(fā)生機(jī)制，然后采用非編碼小分子RNA作為潛在的新藥物。“研究人員還注意到，這類小的非編碼RNA可能對(duì)預(yù)測其他類型的癌癥或疾病有用。
        由癌癥基因組圖譜項(xiàng)目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，為病變組織和正常組織提供了大量的可訪問測序信息，使本工作成為可能?，F(xiàn)在，癌癥基因組圖譜是現(xiàn)存的非編碼小分子RNA的zui大資源之一。