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總RNA提取實驗

時間:2012/12/12閱讀:1519
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總RNA提取可以:()獲得高純度、高質(zhì)量的總RNA;(2)可以滿足生物學(xué)下游實驗NorthernBlot、核酸酶保護實驗、RT-PCR、qRT-PCR 和陣列分析所需。
實驗方法原理 總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質(zhì)量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統(tǒng)采用兩種的RNA酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的降解速率。

GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯(lián)合使用,將促使核蛋白復(fù)合體的解離,使RNA 與蛋白質(zhì)分離,并將RNA釋放到溶液中。而進一步從復(fù)合體中純化RNA ,則根據(jù)Chomczynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA進入水相,這樣使其與仍留在有機相中的蛋白質(zhì)和DNA分離。水相中的RNA 可用異丙醇沉淀濃縮。進一步將上述RNA沉淀復(fù)溶于GTC溶液中,接著用異丙醇進行二次沉淀,隨后用乙醇洗滌沉淀,即可去除所有殘留的蛋白質(zhì)和無機鹽,而RNA 中如含無機鹽,則有可能對以后操作中的一些酶促反應(yīng)產(chǎn)生抑制。
實驗材料 微生物 動物細胞 植物組織
試劑、試劑盒 RNA 提取試劑盒 焦碳酸二乙酯 乙醇
儀器、耗材 恒溫水浴 冷凍高速離心機 紫外分光光度計 取液器 電泳儀 電泳槽
 

實驗步驟 一、細胞或組織破碎

. 微生物材料

()發(fā)酵3-4天(或?qū)?shù)生)的菌體,離心收集菌絲體(動植物材料無需此步處理)。

(2)用經(jīng)DEPC處理的水洗菌絲體2-3次,并盡量除去殘存的水。

(3)加液氮充分研磨,使其成為粉末,以釋放RNA。

(4)研磨后的樣品轉(zhuǎn)移至2 ml變性液的容器中勻漿。

2. 動植物細胞培養(yǎng)材料 (適用的樣品量為細胞:08)

()細胞或組織培養(yǎng):按常規(guī)方法進行。

(2)深層懸浮培養(yǎng)細胞的破碎。

①細胞收集:含一定濃度的細胞培養(yǎng)液置于無菌離心管中,4℃,3 000 g離心5分鐘。

②細胞洗滌:上步沉淀用25毫升滅菌后冰凍的×PBS緩沖液洗滌,然后4℃,3 000 g離心5分鐘。

③細胞破碎:在沉淀細胞中加入5 ml預(yù)冷的變性液,用無菌處理過的勻漿器勻漿。

3. 表面培養(yǎng)細胞的破碎

()確定培養(yǎng)瓶數(shù)量,使選定的各培養(yǎng)瓶細胞累加后總量達08。

(2)細胞收集:將培養(yǎng)液倒掉,用預(yù)冷的無菌PBS緩沖液洗滌一次,在培養(yǎng)瓶中加入8 ml預(yù)冷變性液,轉(zhuǎn)動培養(yǎng)瓶,使細胞溶解,此時可見粘度加大。

(3)用無菌吸管將*個培養(yǎng)瓶中的液體吸入第二個培養(yǎng)瓶,旋轉(zhuǎn),溶解細胞,再吸入第三個培養(yǎng)瓶,以此類推,直到將所選定的培養(yǎng)瓶全部洗滌一次,然后從*個培養(yǎng)瓶開始再加入4毫升上述變性液,將所有培養(yǎng)瓶洗一次。

(4)將上述2 ml含細胞的變性液轉(zhuǎn)移至一50毫升無菌離心管中,勻漿破碎細胞。

3. 植物組織破碎 (適用的樣品量為0.05 g組織)

()將600 ul變性液置于.5 ml離心管中,將此離心管放于冰浴中5分鐘。

(2)將0.05 g新鮮組織用液氮冰凍。

(3)在液氮下,研磨組織塊。

(4)待液氮揮發(fā)后,將上述分散的組織轉(zhuǎn)移至無菌離心管中。

4. 動物組織破碎 (適用的樣品量為 g 組織)

()將2 ml變性液置于50 ml離心管中,將此離心管放于冰浴中5分鐘。

(2)在上述管中加入 g新鮮或冰凍動物組織,勻漿粉碎。

二、RNA 的抽提

() 在經(jīng)變性液勻漿的細胞或組織600 ul+60 ul pH4.0的2 M 乙酸鈉*混勻,可用漩渦振蕩器。

(2)600 ul酚\氯仿\異戊醇(25\24\),*混勻或漩渦振蕩器振蕩0秒。

(3)冰裕中0-5分鐘,離心,4℃,0 000 g,20分鐘。

(4)上層水相吸至無菌離心管中+等體積的異丙醇,-70℃,30分鐘沉淀RNA。

(5)離心4℃,0 000g,20分鐘。

(6)沉淀RNA ,冷凍干燥5分鐘 , RNA 沉淀重新溶于300 ul變性液中,可振蕩(有時為了幫助溶解,可在65℃加熱,但時間應(yīng)極短)。

(7) 60 ul pH4.0的2M乙酸鈉*混勻,可用漩渦振蕩器。

(8) 600 ul酚\氯仿\異戊醇(25\24\),*混勻或漩渦振蕩器振蕩0秒。

(9) 冰裕中0-5分鐘,離心,4℃,0 000 g,20分鐘。

(0)上層水相吸至無菌離心管中。

() 等體積異丙醇二次沉淀(-70℃,30分鐘),75%乙醇洗沉淀,沉淀冷凍干燥,復(fù)溶于去RNA 酶的水中(對于準(zhǔn)備保存的RNA 可加入pH 5.0的乙酸鈉至終濃度為0.25 M,再加入2.5體積的乙醇,-70℃保存。)。

 

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