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寨卡病毒的蚊蟲(chóng)基因組詳圖繪成-齊一生物

時(shí)間:2017-3-29閱讀:200
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科研試劑供應(yīng)商-齊一生物

來(lái)自美國(guó)多個(gè)科研機(jī)構(gòu)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)在近日的《科學(xué)》雜志上發(fā)表論文稱(chēng),他們利用一種名叫“3D 基因組組裝”的突破性技術(shù),組裝出了傳播寨卡病毒和西尼羅病毒的兩種蚊蟲(chóng)的 3 條染色體。新方法不僅將從頭組裝基因組的時(shí)間從幾年縮短至幾天,還能大大降低成本,有望將需要數(shù)百萬(wàn)美元才能完成的創(chuàng)建人類(lèi)基因組項(xiàng)目降到一萬(wàn)美元以?xún)?nèi)。

基因組內(nèi)具有*的堿基序列,但現(xiàn)有測(cè)序工具只能測(cè)出堿基草圖,破譯這些堿基的具體排序或相互位置關(guān)系往往更加復(fù)雜耗時(shí),特別是有些物種的基因組巨大,如人類(lèi)基因組有 30 億個(gè)堿基對(duì),小麥基因組有 170 億個(gè)堿基等。拿人類(lèi)基因組測(cè)序來(lái)說(shuō),雖然已經(jīng)耗時(shí) 10 年,花費(fèi)數(shù)十億美元繪制出人類(lèi)基因組草圖,但因?yàn)槊總€(gè)人基因組的特異性,要參考人類(lèi)基因組草圖在臨床測(cè)序結(jié)果中尋找變異,往往會(huì)被誤導(dǎo)。

由拜耳醫(yī)學(xué)院牽頭,萊斯大學(xué)、德克薩斯兒童醫(yī)院和麻省理工與哈佛組建的博德研究院參與的研究團(tuán)隊(duì),幾年前曾研發(fā)出一種實(shí)驗(yàn)性方法,成功確定了一條兩米長(zhǎng)基因組是如何折疊進(jìn)細(xì)胞核內(nèi)的。這次,該團(tuán)隊(duì)通過(guò)基因組折疊的指引,成功用短鏈 DNA 從頭組建成埃及伊蚊和致乏庫(kù)蚊的染色體。

傳播寨卡病毒的埃及伊蚊的基因草圖早在 10 年前就已繪出,但其中未知的關(guān)鍵細(xì)節(jié)阻礙了寨卡暴發(fā)期間的研究進(jìn)展?,F(xiàn)在,3D 基因組組裝技術(shù)能從頭組裝出該蚊蟲(chóng)的全部基因組,將幫助科學(xué)家們采取更有力措施應(yīng)對(duì)寨卡等流行病。

新方法還適用于從頭組建人體基因組?,F(xiàn)有 1000 美元基因組測(cè)序項(xiàng)目中,只能對(duì)某些細(xì)胞內(nèi)基因組測(cè)序,且在準(zhǔn)確性方面嚴(yán)重可疑。而要從頭組裝出一個(gè)人的所有染色體,現(xiàn)有技術(shù)可能要花幾年時(shí)間、數(shù)百萬(wàn)美元才能完成,幾乎無(wú)病人能夠負(fù)擔(dān)得起。利用這次研發(fā)的新技術(shù),從頭組裝某個(gè)病人的基因組幾乎與接受一次核磁共振檢測(cè)相當(dāng),不到一萬(wàn)美元。

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