1.概 述
mRNA差異顯示技術(shù)(mRNA differetial display)是一種快速有效的克隆差異性表達(dá)基因的方法。
方法建立:1992年 Liang P和Pardee應(yīng)用DD技術(shù)對比人類乳腺癌細(xì)胞與正常細(xì)胞所表達(dá)的mRNA,以此來克隆癌細(xì)胞所*的基因
目前已應(yīng)用于個各領(lǐng)域:
農(nóng)業(yè)、植物
動物
醫(yī)學(xué)
? 胚胎發(fā)育
? 遺傳病
? 藥物
? 腫瘤
2.mRNA差異顯示原理
是分離差異表達(dá)基因的一個重要方法。人類大約含有三萬個不同的基因。在不同的單個細(xì)胞中只有10%的基因處于表達(dá)狀態(tài)。
生物體在不同的生理,病理狀態(tài)下,基因的表達(dá)水平不同。
生命過程中選擇性表達(dá)的基因主要有:發(fā)育與分化、體內(nèi)平衡、對攻擊的應(yīng)答、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、老化和程序性細(xì)胞死亡等。
差異顯示獲得的只是某個基因的片段,而不是直接獲得全長cDNA克隆。
3.基本程序
選擇表型特性差異顯著對象
展示mRNA的差異
基因差異
克隆與表型差異高度相關(guān)的新基因
4.技術(shù)
? 基本技術(shù)
逆轉(zhuǎn)錄( RT )
聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)
凝膠電泳
5.RT-PCR
? 錨定引物 T12-MN,含有12個T可以結(jié)合于mRNA 3`端 poly(A)尾,M為A、C、G 3種堿基之一,N為A、T、C、G 4種堿基之一。
? 熒光錨定引物 ,引物5`端加入T7 RNA多聚酶啟動子并帶有熒光分子
----------- AAAAAAAAAA –3` mRNA
------------XAAAAAAAAAAA–3` 1/3 mRNA
MTTTTTTTTTTTT(12T) Prime
---------YXAAAAAAAAAAAAA –3` 1/12 mRNA
NMTTTTTTTTTTTT(12T)Anchor Prime
?熒光錨定引物:
NMTTTTTTTTTTTT-T7 RNA多聚酶啟動子-熒光分子
(Genomyx company)
因此共有12種錨定引物
?同位素標(biāo)記錨定引物
?隨機引物 (Arbitrary Prime)
可以隨機地與cDNA不同位置多個位點結(jié)合,擴(kuò)增出不同長度的cDNA片段混合物。
共20種隨機引物,隨機引物-M13
?隨機和錨定引物的多種組合可以展示10000-15000種mRNA