載體及目的DNA 片斷經(jīng)酶切后,如果無多余的片斷(如載體單切)可以直接酚/氯仿抽提后乙醇沉淀回收直接連接用。但多數(shù)還有多余片斷(如載體雙酶切后有插入片斷但要回收空載體,多個目的DNA片斷選擇其一克?。?,必須電泳分離后回收目的片斷?;厥盏姆椒扔袀鹘y(tǒng)的方法,這些方法基于降低凝膠的熔點以釋放DNA,然后通過酚/氯仿抽提后乙醇沉淀回收,也有公司生產(chǎn)的商品化的試劑盒可用,這些試劑盒多采用凝膠裂解液(如含有降低熔點的NaI)融化凝膠釋放DNA后,采用特殊的硅膠樹脂吸附DNA后,用洗液洗去雜質(zhì),zui后用洗脫液洗出DNA。
一.材料、試劑和儀器:
1 材料:待回收DNA樣品
2試劑:
1) 1% 低熔點膠,瓊脂糖,
2) glassmilk kit: 裂解緩沖液,漂洗液,glassmilk
3) TE, ddH2O,
4) 酚/ 氯仿, 氯仿, 無水乙醇,70%乙醇,
5) DNA回收試劑盒: 樹脂, 80%異丙醇,Syringe Barrel,
3儀器: 離心機 , 水浴鍋, 電泳儀
二 實驗程序:
2.2.1 低熔點膠法:
1) 電泳到適當位置后在目的DNA條帶的前端挖一長方形槽,向槽中加入融化的低熔
點膠,待凝固后進行電泳。當DNA進入低熔點膠中心時停止電泳。紫外燈下切下目的條帶的低熔點膠。
2) 將切下的膠放到離心管中,加入200ul的TE,65℃溫浴3min以融化低熔點膠。
3) 分別用酚/氯仿,氯仿抽提一次。
4) 取上清,加入2倍體積的無水乙醇,-20℃沉淀DNA 2hr以上,12 000rpm離心15min,棄上清,用70%乙醇洗滌,吹干后溶于10ul無菌水中,取1ul電泳檢測。
2.2.2. 凍融法:
1) 電泳后直接切下凝膠中目的條帶后加200ul TE,再加2倍體積酚,在液氮中
凍2min ,再65℃水浴中融化10min,這樣重復數(shù)次.
2) 10 000g離心5 min,取上相液加2倍體積冰乙醇-20℃沉淀過夜。
3) 離心回收DNA,70%乙醇洗一次后溶于適量的TE或無菌水中,電泳檢測回收
效果。
2.2.3 Glassmilk法:
2.2.4. 試劑盒法(Technical bulletin of Wizard PCR Preps DNA Purification system Promaga公司):
1) 電泳分離PCR產(chǎn)物。
2) 用干凈無菌的刀片切割目的DNA條帶,放入1.5mL Ep管中,積累凝膠至大約300ul。
3) 在裝有凝膠的離心管中加入1mL樹脂, 65℃水浴5min或直到凝膠*溶解。
4) 拔出注射器活塞備用,將 Syringe Barrel和Minicolumn 連接。
5) 將樹脂DNA混合液移入Syringe Barrel中,插入活塞緩慢將混合液推入
Minicolumn.
6) 分開syringe Barrel和Minicolumn ,去掉活塞。重新連接Syrringe Barrel和
Minicolumn, 加入2mL 80%異丙醇到Syringe中以洗柱子。插入活塞,緩慢將
異丙醇推入Minicolumn。
7) 去掉Syringe,將Minicolumn移入1.5mL離心管中,10 000g(半徑5.5~6cm
13000rpm)離心2min以干燥樹脂。
8) 將Minicolumn放入一新的離心管中,加入50ul ddH2O或TE到Minicolumn中,
放置1min,10000g,離心20sec。
9) 去除Minicolumn,將純化的DNA貯存于4℃或-20℃。
二.結(jié)果分析:
DNA純化回收后, 電泳檢測應(yīng)為單一的條帶。如果切膠過程中不慎帶上雜帶, 那么回收后電泳結(jié)果可能會出現(xiàn)兩條以上的帶。這時可以進行重復純化回收。