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一、假陰性(無擴增產(chǎn)物)
現(xiàn)象:正對照有條帶,樣品無條帶
可能原因:
· 模板:含有 Taq 酶抑制劑、雜蛋白,模板上樣量低或模板降解
· 引物:引物降解,引物設計不合理
· 試劑:酶失活,buffer 不合適
· 反應條件:退火溫度高,延伸時間短
解決方法:
· 純化模板并重新提取,并檢測模板是否含有抑制劑
· 重新設計引物并低溫保存
· 優(yōu)化 buffer,摸索鎂離子濃度或適當加入 DMSO(小于 0.3%)
· 提高退火溫度,增加延伸時間(反應條件參照試劑盒說明書)
二、假陽性
現(xiàn)象:空白對照出現(xiàn)條帶
可能原因:
· 引物設計不適,與目的序列具有同源性
· 試劑污染:水、移液槍等被核酸污染
· 樣品間出現(xiàn)交叉污染
解決方法:
· 實驗儀器高壓滅菌
· 實驗試劑(酶除外)高壓滅菌,離心管槍頭一次性使用
· 規(guī)范實驗操作
· 假陽性可通過巢式 PCR 解決,或者使用特異性較高的試劑盒擴增
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